gwas snp 和_全基因组关联分析(GWAS):为何我的QQ图那么飘

前段时间有位小可爱问我,为什么她的QQ图特别飘,如果你不理解怎样算飘,请看下图:

94730dabda7cbc9b4d0388fecba67e99.png

理想的QQ图应该是这样的:

7655ac92982251297e662049ad01d308.png

我当时的第一反应是:1)群体分层造成的;2)表型分布有问题。因此让她检查一下数据的群体分层情况,如果没有问题就看一下表型分布。

这段时间有空了,我觉得有必要梳理一下这个飘逸的QQ图,到底是怎么回事儿以及如何确定这么飘逸的QQ图有没有问题。

1.产生飘逸的QQ图的原因

产生飘逸的qq图的原因有很多,比如我们喜闻乐见的:基因多效性(polygenicity)。也有可能是混淆偏倚,比如群体分层,假如样本中混合了欧洲、非洲、亚洲等各个地方的群体,本身各个群体的SNP频率差异就很大,如果不加以群体分层控制,关联分析的时候就会产生很多偏离预期值的SNP位点。

很久以前,出现飘逸的QQ图的话,我们可以搭配膨胀系数(膨胀系数的计算&#

  • 0
    点赞
  • 3
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值