GWAS网站总结（解放收藏夹）
跑通GWAS，用这些脚本就够了.
WGS全基因组分析||VCFTOOLS使用.
convert VCF to HMP format.
VCF格式的学习及对VCF文件的统计.
生物信息数据格式：vcf格式.
vcftools用法详解.
收集VCFTOOLS所有用法.
vcf文件与vcftools（二）.
统计SNP数据的缺失率,MAF,Heterozygote.
转载vcftools基于全基因组snp数据如何进行主成分分析（PCA）.
全基因组关联分析（GWAS）-统计方法与模型简介.
全基因组关联分析（GWAS）常见问题（工具，概念，脚本）.
2018-11-01GWAS实战（四）plink 进阶之数据过滤.
Python pandas 染色体 SNP 位点提取 并排序.
vcf格式解读及vcftools简介.
awk提取文件第一列.
全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）20210313更新版.
GWAS基因芯片数据预处理：质量控制（quality control）.
linux 命令 去掉重复行.
linux提取指定列字符并打印所有内容（awk）.
Linux根据一个文件的列内容提取另一个文件的行.
PCA的分析.
生信笔记——PCA分析.
Plink分析执行记录.
plink提取指定样本和指定SNP的数据（keep，extract函数）.
去除数据重复--------Linux下文本文件合并和去除重复操作.
笔记 GWAS 操作流程2-5：杂合率检验.
Calculating Heterozygosity for each SNPs..
plink 1.9.
2018-11-02 GWAS实战（五）plink 进阶之数据过滤一条命令.
笔记 GWAS 操作流程2-5：杂合率检验.
PRS（polygenic risk score）.
玉米全基因关联分析 ( GWAS Analysis Pipeline ).
plink.
vcftools去除或保留vcf文件中的样品.
用plink做一套GWAS分析.
GWAS分析软件GAPIT学习笔记.
跑通GWAS，用这些脚本就够了.
利用Tassel进行GWAS分析.
GWAS分析.
gwas分析培训班第二期.
我的GWAS学习笔记.
全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）.
GAPIT使用教程.
从零开始学GWAS之EMMAX使用.
从零开始学GWAS之数据格式.
GWAS分析-说人话（1）什么是GWAS，都分析啥？.
GWAS分析-说人话（2）认识文件名.
GWAS分析-说人话（4）打开文件.
GWAS分析-说人话（6）keep提取我们需要的表型数据 II.
GWAS分析-说人话（14）- 如何查看SNP的基因型.
2018-10-31 GWAS实战（三）plink 进阶之认识常用文件格式.
GWAS分析基本流程及分析思路.
GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）.
一行命令学会全基因组关联分析(GWAS)的meta分析.
GWAS分析基本流程及分析思路.
利用vcftools比较两个vcf文件.
VCFtools的使用.
Hapmap 格式转 plink（.ped, .map）格式.
使用qqman包绘制曼哈顿图和QQ图.
重复一篇文献的GWAS（二）：用GEMMA跑GWAS.
使用GEMMA进行复杂性状全基因组关联分析(GWAS).
如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息.
文献笔记五十四：全基因组关联分析鉴定拟南芥中控制种子大小的调节因子.
2018-10-25 GWAS实战（一） qqman绘制曼哈顿图.
使用GWAS结果绘制曼哈顿图和QQ图——qqman.
利用R包qqman画曼哈顿图.
GWAS中曼哈顿图和QQ plot的画法.
GWAS和群体遗传学笔记.
如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息.
GWAS分析说人话.
GBS hapmap 格式 转化为Plink格式：tassel vcftools方法汇总.
如何使用Tassel 做GWAS 说明文档.
笔记 | GWAS 操作流程1：下载数据.
使用PLINK做GWAS（2）.
Bio|manhattan图.
GWAS分析没有显著结果怎么办.
GWAS之表型最优无偏预测（BLUP)与遗传力计算.
Rscripts.
linux上安装Plink.
linux-按列筛选文件-统计筛选结果并输出指定列-awk.
Beagle使用.
如何将基因型数据转为 012 格式.
笔记 GWAS 操作流程2-3：最小等位基因频率.
群体分析进化树，mega相关.
操作流程5-1：根红苗正的GWAS分析软件：GEMMA.
GWAS | 使用GEMMA进行全基因组关联分析.
基因型数据012及-1,0,1计算基因频率.
变异结果 vcf 格式转换成 hapmap格式.
怎样估算遗传距离？.
群体遗传学之个体间遗传距离及其计算方法.
PCA主成分分析实战和可视化 | 附R代码和测试数据.
vcfR高效处理VCF文件.
pheatmap绘制“热图”，你需要的都在这.
Tassel 命令行版本使用笔记.
vcftools报错：Writing PLINK PED and MAP files … Error: Could not open temporary file.解决方案.
笔记 GWAS 操作流程2-5：杂合率检验.
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