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dump image命令直接输出的图片
在前面的介绍中,我们依次介绍了LAMMPS创建模型,力场与势函数,变量命令以及操作fix命令和计算compute命令。在完成这些命令的设置之后,最终得到的计算结果包括体系的热力学量,各个原子的位置坐标与速度等信息,还要通过合理的方式输出并通过可视化或图表处理,才能获得能够指导实验与理论研究的模拟结果。因此,学习包括log, dump, thermo, thermo_style, thermo_modify 等等在内的输出命令也是学习LAMMPS的重要部分。本文将依次介绍上述输出命令的主要用法。
log命令
语法
log file keyword
file:为新的日志文件的文件名
keyword:为关键字,只有一个选择,即append。如果添加该关键字,接下来的输出会附加在指定的log文件中,而不是重新创建。
举例
log log.equil
log log.equil append
说明
在读取了in文件之后,LAMMPS会同时在终端屏幕上和日志log文件里同时输出模拟的初始化信息,预测模拟时长,给出内存的占用量和每隔一定步数的热力学信息,如下图所示:
loop time是模拟运行的实际时间,以秒为单位。Performance预测了完成模拟所需的时间,例如上例