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当然还有更多R语言,生物信息学相关知识。。。?
Nomogram,也常称为诺莫图或者列线图,在医学领域的期刊出现频率越来愈多,常用于评估肿瘤学和医学的预后情况,可将Logistic回归或Cox回归的结果进行可视化呈现。
数据准备
使用TCGA-LIHC队列的临床数据,简单处理后进行示例分析:
## 载入R包
library(rms)
library(survival)
## 读取LIHC数据
LIHC <- read.csv("TCGA-LIHC-nomogram.csv",header=TRUE)
head(LIHC)
绘制nomogram图
1)打包数据
## 关键步骤:按照nomogram要求“打包”数据,可以输入??datadist查看详细说明
dd=datadist(LIHC)
options(datadist="dd")