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关 注如何使用Excel
进行基因平衡检验
关键词:Excel 基因平衡性检验
“基因平衡性检验”小贴士Hardy-Weinberg equilibrium(HWE)平衡定律,中文翻译为哈迪-温伯格平衡定律,在遗传学中有着非常重要的地位。该平衡定律是群体在繁殖上下代之间基因频率与基因型频率是否保持均衡的检验尺度。基因平衡性检验也就是进行哈迪-温伯格平衡定律的检验。
基因平衡性检验基于统计学中的Pearson卡方检验实现的,在Excel中进行基因平衡性卡方检验方便简洁。
案例视频教程接下来,我们以实际案例为基础,详细讲述基因平衡性检验步骤及结果的分析方法。
请观看下方视频教程
(若无法播放,请联系客服微信3301888200)
案例数据:
基因平衡性检验步骤:
Step1:计算基因型实际频率
TT实际频率:85/500=17%
CT实际频率:222/500=44.4%
CC实际频率:193/500=38.6%
Step2:计算等位基因频数
T频数:85*2+222=392
C频数:193*2+222=608
Step3:计算等位基因频率
T实际频率:392/(392+608)=39.2%
C实际频率:608/(392+608)=60.8%
Step4:计算基因型理论频率
基因型理论频率计算公式是基于:
TT理论频数:0.154*500=77
CT理论频数:0.477*500=238.5
CC理论频数:0.369*500=184.5
Step5:基因平衡性检验——卡方检验
基于以上的理论频数和实际频数计算卡方值:
更进一步,运用以上卡方值计算P值(自由度df=2)
在Excel中输入:
计算出P=0.307>0.05,意味着该500人的样本人群的该基因频率符合遗传平衡法则,具有恒定性。
相反,如果计算结果得到P<0.05,意味着样本人群该基因频率不符合遗传平衡法则。
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