相关系数矩阵计算_如何理解mantel检验就知道矩阵和单列变量数据的相关

本文介绍了mantel检验在微生物生态学中的应用,它基于距离矩阵的相关分析。通过将矩阵转换为向量并进行相关性计算,mantel检验能揭示两个矩阵间的关联性。相关系数范围在-1到1之间,可用来比较不同矩阵的关系。此外,文章还讨论了如何计算矩阵与单列变量之间的相关性,并提供了mantel检验的可视化方法和相关资源。
摘要由CSDN通过智能技术生成

写在前面

在微生物生态学领域,经常用的mantel检验,原理来讲,很是简单,就是一个距离矩阵的相关分析而已,但是这层窗户纸似乎存在很长时间,大家都对这个分析的原理有些忌惮,所以今天就之前的文档,来告诉大家如何理解mantel并且在一些文章中的运用做一个解释。

数据框—矩阵—距离矩阵

这三个数据类型类似,但是在R语言中是区分的,我们要做一个了解:

  • 注意,距离矩阵是只有左下方一半的对角阵。

    #数据框
    data.frame()
    as.data.frame()
    # 矩阵
    matrix()
    as.matrix()
    # 距离矩阵
    dist()
    as.dist()

    mantel检验的原理

    mantel检验在生态中运用的十分多,尤其是在微生物群落和环境因子之间关系的检验上:

    1a66cdad4fa9e9c9d92f684cbd2b0233.png

    mantel检验是Mantel’s 在1967年提出来的,基于回归分析。

    使用相似性距离或者相异性距离矩阵来做双向检验。

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值