centOS8 安装samtools 1.10

centOS8/Ubuntu 安装samtools 1.10

samtools已经更新到1.10，新增了一些功能，特别是支持长度超过2G的染色体的处理，刚好需要使用到这个功能，于是安装个samtools 1.10，因为系统自带源的samtools是1.9版本（可直接yum install samtools安装），因此需要自己下载安装包安装。

1. 下载安装包

wget https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.10/samtools-1.10.tar.bz2
tar -jxvf samtools-1.10.tar.bz2

2. centOS8 安装依赖（不同的系统可能不同，因为我这个是新系统，很多依赖环境没有安装）

yum install zlib-devel
yum install ncurses-devel
yum install bzip2-devel
yum install xz-devel
yum install curl-devel

3. 编译

./configure
make
make install

完成

对于Ubuntu系统，安装的依赖包有所不同

sudo apt-get install libncurses5-dev
sudo apt-get install libbz2-dev
sudo apt-get install zlib1g.dev
sudo apt-get install liblzma-dev
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
sudo apt-get install apache2
sudo apt-get install libssl-dev

一条命令安装

sudo apt-get install libncurses5-dev libbz2-dev zlib1g.dev liblzma-dev  libcurl4-openssl-dev apache2 libssl-dev