rosetta安装中的mpiCC command not found

最新推荐文章于 2024-04-10 17:16:53 发布
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分类专栏： linux 分子动力学
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个人经历，仅供参考

原因

在进行rosetta编译的过程中，虽然当前用户能够找到mpiCC,并且利用which命令能够找到mpiCC（假如which 找不到那么就用源码安装），但是编译的时候还是提示命令找不到。发现在/root/.bashrc中添加mpiCC的路径，然后source之后就可以安装，我认为主要是因为在利用sudo执行的时候会以root的身份进行编译，但是root找不到mpiCC的路径导致的

weixin_43364556
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彻底解决：-bash: mpiexec: command not found
沉迷单车的追风少年
09-30 2126
目录 问题核心： 最简单解决方案 手动安装解决方案 打开网址： 解压： 进入文件夹后执行： 编译安装： 配置环境变量： mpiexec是运行MPI并行程序的指令，MPI有以下的特点： 消息传递式并行程序设计 指用户必须通过显式地发送和接收消息来实现处理机间的数据交换。 在这种并行编程中，每个并行进程均有自己独立的地址空间，相互之间访问不能直接进行，必须通过显式的消息传递来实现。 这种编程方式是大规模并行处理机（MPP）和机群（Cluster）采用的主要编...
rosetta软件ubuntu编译安装；PatchDock 安装使用问题
weixin_42357472的博客
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参考：下载（需要先注册License）：https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download安装文档：https://www.rosettacommons.org/demos/latest/tutorials/install_build/install_build#downloading-rosetta。
rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法
mhx123456789的博客
08-10 1079
rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法
Debug模式编译openfoam报错wmake mpi /home/jie/anaconda3/bin/mpicc: 行 323: x86_64-conda-linux-gnu-cc: 未找到命令
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MPI并行计算中 -bash: mpigxx: command not found解决方法
Ace Cheney的博客
06-05 7471
解决方法：将mpigxx指令换成mpic++指令即可 MPI并行计算编译总结 串行C程序： 编译： gcc -o 输出文件名 编译文件名.c 运行：./输出文件名 串行C++程序： 编译： g++ -o 输出文件名 编译文件名.cpp 运行：./输出文件名 并行C程序 编译：mpicc -o 输出文件名 编译文件名.c 运行方式1：./输出文件名 （只调用一个cpu，相当于串行运行） 运行...
linux没有mpicc怎么编译mpi,Linux下MPI并行编程环境搭建配置
weixin_39757169的博客
05-02 514
MPI的全称是Message PassingInterface即标准消息传递界面，可以用于并行计算。MPI有多种实现版本，如MPICH，CHIMP以及OPENMPI。这里我们采用MPICH版本。一、MPICH安装tar -xzvf soft/mpich-3.0.4.tar.gzcd mpich-3.0.4/./configure --prefix=/usr/local/mpichmake &amp...
linux下Rosetta从头预测软件的安装使用.pdf
11-21
linux下Rosetta从头预测软件的安装使用.pdf
wsl中rosetta的安装（Ubuntu20.04）
weixin_41439798的博客
03-03 1621
windows子系统wsl Ubuntu20.04安装rosetta
怎么解决 MacM1 zsh: command not found: npm
04-23
此外，还可以在终端中安装 Homebrew，并使用以下命令来安装 Node.js： ``` arch -x86_64 /bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install.sh)" ``` ``` arch -x86...
rosetta软件中英文使用说明
05-11
**Rosetta软件中英文使用说明** Rosetta是一款广泛应用于蛋白质结构预测、设计和改造的分子模拟软件。它是由美国华盛顿大学生物化学系的Rosetta Commons团队开发的，并且在全球生物信息学和计算生物学领域有着重要...
linux 下编译radius时出现libtool: Command not found 的错误
sfhjy的专栏
12-17 1762
linux 下编译radius时出现libtool: Command not found    用命令查看libtool存在已经存在了，为什么会报错呢？后面认真分析了下，  原因是系统的ibtool版本不同，解决办法是重新生成makefie，执行如下命令:   make distclean   ./configure  --prefis=/usr/local/radius  
mpicxx: command not found的解决方法
猫主席
02-09 3981
最近在学并行计算MPI，按照正常流程下载安装了之后，再输入命令行 mpicxx Exercise.cpp 却出现了“mpicxx: line 283: x86_64-apple-darwin13.4.0-clang++: command not found”的报错 并不存在缺失文件和库 除了网上常见的很多解决方法，尝试下可能和激活环境有关，输入下面查看 conda env list 我的电脑里果然是有2个环境（之前做别的用的） 激活另一个环境 conda activate xxxx 再执行我
Linux下安装mpich提示all-recursive: command not found解决方法
小白的进阶之路
11-12 2064
Linux下安装mpich提示all-recursive: command not found解决方法 经过查找，下载的mpich版本过高，降低版本即可
Linux安装HDF5及遇到的问题总结
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1.安装HDF5 2.执行示例程序 3.使用HDFView查看hdf5文件
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weixin_42412850的博客
02-01 449
一：Linux下安装与配置MPICH为了在Linux下运行我们的并行程序，我们需要安装MPICH，现在的版本是MPICH2，下载地址：mpich2-1.5.tar.gz [文件大小：21.77 MB] 下载：用户名：www.linuxidc.com密码：www.muu.cc在 2012年LinuxIDC.com\10月\Linux CentOS下安装MPICH以及运行第一个并行程序下载完成后，用...
权限问题
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1. 今日在使用interface文件夹下的程序时，服务器总是提示mpicxx：command not found，经过和王师兄研究，认为是我的帐户权限不足，无法使用mpicxx命令，无奈，请YuanBo帮我提升了权限。2. 提升权限之后，利用make命令生成exe文件，但是提示interface/*.o处有问题，无法生成exe，后来发现是Makefile文件中有几行命令代码被注释掉了，去掉注
make: command not found 的解决办法
mihaoyun.com的专栏
06-12 2万+
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安装mpich
sw_zfr
08-02 1028
Linux 下 mpich2 安装   1：从MPICH2官网下载源代码，http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2 /downloads/tarballs/1.0.8/mpich2-1.0.8.tar.gz  目前最新的是1.0.8，当然如果你使用的windows平台也可以下载http://www.mcs.anl.gov/resear
make: command not found 解决办法
网络安全领域优质创作者
06-30 4万+
出现错误：-bash: make: command not found 原因分析：一般出现这个-bash: make: command not found提示，是因为安装系统的时候使用的是最小化mini安装，系统没有安装make、vim等常用命令，直接sudo apt-get install安装下即可。 解决方法： sudo apt-get update sudo apt-get install gcc automake autoconf libtool make 直接ssh运行即可，安装make.
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