Euk-mPLOC:预测真核生物蛋白的亚细胞定位

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对于蛋白质功能研究而言，亚细胞定位是非常重要的分析内容。蛋白质在细胞中是流动的，所以一个蛋白可以具有一个到多个的亚细胞定位信息。比如转录因子等蛋白，其亚细胞定位是动态变化的，在不同亚细胞中产生不同的细胞功能。

了解蛋白质的亚细胞定位信息，可以对预测其生物学功能提供帮助。Euk-mPLOC是一个在线软件，可以预测真核生物蛋白的亚细胞定位。网址如下

http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/euk-multi-2/

将亚细胞定位分成了以下22种不同区域

1. Acrosome

2. Cell wall

3. Centriole

4. Chloroplast

5. Cyanelle

6. Cytoplasm

7. Cytoskeleton

8. Endoplasmic reticulum

9. Endosome

10. Extracell

11. Golgi apparatus

12. Hydrogenosome

13. Lysosome

14. Melanosome

15. Microsome

16. Mitochondrion

17. Nucleus

18. Peroxisome

19. Plasma membrane

20. Spindle pole body

21. Synapse

22. Vacuole

    
    图示如下：

软件的用法也非常简单，输入FASTA格式的蛋白质序列就可以了

预测的结果如下

对于每条输入的蛋白序列，都会给出预测到的多个亚细胞定位信息。

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