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miRbase 是由曼彻斯特大学的研究人员开发的一个在线的miRNA数据库,该数据库中收录了来自200多个物种,接近4万个miRNA的信息,是最全面的miRNA数据库,网址如下
http://www.mirbase.org/index.shtml
我们可以方便的检索和浏览该数据库中的信息,以human为例, 在Browse
菜单中,可以检索到hman的所有miRNA前体,示意如下
ID
代表miRNA前体的名字, Accesion
代表miRNA 前体的编号;RPM
为Reads perl million mapped的缩写,代表miRNA前体的表达量;Chromosome
, start,
end,
strand表示miRNA前体所在的染色体位置信息,
Confidence`表示可信度。
以hsa-let-7a-1
为例, 点击该链接可以查看详细信息,在详情页面,可以得到这个miRNA前体对应的基因ÿ