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FANTOM全称如下
Function Annotation Of The Mammalian Genome
是一项国际性的研究项目,创建于2000年,最初的目的是对小鼠全长cDNA序列进行功能注释。随着不断发展,研究的内容在也在转录组学层面不断拓展。
在该项目的第三个阶段,采用了CAGE-seq这一技术手段来准确研究不同转录本的转录起始位点TSS
, 示意如下
CAGE
技术可以区分不同转录本异构体的起始位点。建立在准确的TSS
位点的基础上,进一步对启动子,增强子等转录调控区域进行研究和分析。
除了常规的蛋白编码基因和转录调控外,该项目还在lncRNA, miRNA等非编码RNA,即ncRNA领域进行了研究。相关结果和数据面向全世界开放的,可以在官网下载得到。
今天要介绍的是从该项目中得到的增强子数据,网址如下
http://slidebase.binf.ku.dk/human_enhancers/
通过Human Enhancer Selector