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大多数的增强子数据库利用chip_seq,DNase_seq和CAGE_seq的数据来鉴定增强子, HACER
则通过GRO_seq和PRO_seq来分析增强子RNA,从而达到鉴定已经激活的增强子的目的。对应的文章发表在Nucleic Acids Research上,链接如下
https://academic.oup.com/nar/article/47/D1/D106/5106142
与其他增强子数据相比较的情况示意如下
该数据库的网址如下
http://bioinfo.vanderbilt.edu/AE/HACER/
对于鉴定到的增强子区域,该数据库同样提供了以下3种调控关系
TF-Enhancer
Enhancer-target gene
Enhancer-promoter
同时对于增强子对应的基因组区域,还提供了该区域内的GWAS SNP和eQTL 变异位点信息,图示如下