HEDD:增强子疾病相关数据库

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增强子作为一种重要的基因组顺式作用元件，在转录调控中发挥重要作用，参与很多的生物学过程，当然也包括了疾病的发生与发展。

HEDD是一个人类增强子和疾病相关的数据库，收集整理ENCODE, FANTOM, RoadMap项目中鉴定到的增强子，并通过增强子与靶基因的调控关系，靶基因与疾病的关联，建立起增强子与疾病之间的关系，对应的文章发表在Nucleic Acids Research上，链接如下

https://academic.oup.com/nar/article/46/D1/D113/4564801

该数据库的网址如下

http://zdzlab.einstein.yu.edu/1/hedd.php

目前共收录了2,793,316个增强子，包括RoadMap项目中采用ChromHMM软件预测到的2,328,833个增强子，FANTOM5项目中采用CAGE测序分析预测到的65,359个增强子和ENCODE项目中同时采用Segway和ChromHMM两款软件共同预测得到的399,124个增强子，示意如下

对于增强子基因组区域内包含的各种元件进行注释，提供了以下5种基本注释信息

1. DHS
   DNase酶超敏位点注释

2. TFBS
   转录因子结合位点注释

3. Histone modification
   组蛋白修饰注释