chromatin loops:染色质环简介

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利用5kb分辨率的Hi-C基因组互作图谱，科学家识别到了chromatin loop这种染色质结构，文章发表在cell上,标题如下

A 3D Map of the Human Genome at Kilobase Resolution Reveals Principles of Chromatin Looping

链接如下

https://www.cell.com/fulltext/S0092-8674(14)01497-401497-4)

通过对不同分辨率的Hi-C图谱进行分析，检测到了不同层级的染色质结构，从高到低依次为A/B compartments, subcompartments, TAD, chromation loop。Hi-C图谱和染色质结构模型的对应关系如下

早期研究中利用1MB的Hi-C图谱 ，定义了每条染色质包含了A和B两个compartments。该文章中对100kb分辨率的HI-C图谱进行聚类分析，发现A/B compartments进一步分成了6个子类，即subcompartments。对每条染色质的Hi-C图谱进行不同算法的聚类分析，除了19号染色质外，都得到了5个cluster，对于19号染色质，得到了6个cluster。

通过分析这些subcompartments与A/B compartments的关系，发现其中2个属于A compartments, 标记为A1和A2, 另外4个属于B comprtmants,