Oncomine:肿瘤芯片数据库

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肿瘤作为人类健康的头号杀手，其研究的重要性不言而喻。随着芯片和NGS技术的发展，发表了很多的肿瘤相关数据。然而这些数据来自不同的组织和团队，由于缺乏统一的数据管理和组织，这些数据在发表之后就没有再利用了，为了提高数据利用率，促进肿瘤研究的发展，Oncomine的开发团队收集了各种来源的肿瘤相关的芯片数据，用标准化的分析流程处理这些数据，数据分析的结果通过web服务查询和可视化，对应的文章链接如下

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1635162/

数据库的网址如下

https://www.oncomine.org/resource/main.html

该网站只对科研工作者免费开放，需要学术邮箱注册对应的账号。该数据库中主要收录了以下两种类型的肿瘤芯片数据

1. mRNA  expression

2. DNA copy number

每批芯片数据用dataset表示，所有芯片数据对应的肿瘤类型和样本数示意如下