2021最新常用肿瘤生信数据库收藏级汇总！

今天小编为大家分享的是全网最全的肿瘤生信分析的数据库合集！

小编为大家爆肝整理了近百个数据库！共分10大类。今天小编先为大家分享前5类。
在整理的过程中，小编发现一些虽然是以前经常被大家推荐使用的数据库，但却已不再维护了，早已不能正常使用了，这种数据库小编也已经贴心的帮大家过滤掉了。那就快来看看有没有你需要的吧！

 

数据库分类

 

1. 综合性肿瘤数据库

2. 肿瘤转录组数据库

3. 基因组数据库

4. 遗传变异数据库

5. DNA甲基化数据库

6. 蛋白组数据库

7. 肿瘤驱动基因数据库

8. 具体癌种或疾病数据库

9. 药物与癌细胞系相关数据库

10. 通路pathway数据库

 

 

 

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数据库列表

 

 

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 综合性肿瘤数据库

TCGA（The cancer genome atlas）：

TCGA（The cancer genome atlas，癌症基因组图谱）由 National Cancer Institute(NCI，美国国家癌症研究所) 和 National Human Genome Research Institute（NHGRI，美国国家人类基因组研究所）于 2006 年联合启动的项目， TCGA对超过20,000例原发性癌症进行了分子特征分析，并同时存储了33种癌型配对的正常样本。

 

ICGC：（International Cancer Genome Consortium）：

ICGC全称是International Cancer Genome Consortium。ICGC数据包括50种不同癌症类型/亚型的肿瘤中的基因组异常（体细胞突变，基因异常表达，表观遗传修饰）数据，也包括TCGA中的数据。

 

COSMIC：

COSMIC收录在癌症中体细胞突变的数据，是世界上最大和最全面的癌症突变资源，用于探索人类癌症中体细胞突变的影响。它主要提供肿瘤细胞基因组中的CNA、甲基化、基因融合、SNP及基因表达等数据。

 

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