背景校正，芯片预处理的第一步！

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对于芯片数据而言，在分析之前，需要先进行背景校正background correct。所谓背景校正，其本质上都是一个减法，将总体信号看做由探针特异性的结合信号(真实信号)和非特异性结合(噪声信号)两部分组成，背景校正的工作就是从总体信号中减去噪声信号，从而得到真实信号。

具体到应用层面，有多种算法可供选择，在limma包中，通过backgroundCorrect函数提供了各种算法的接口，具体如下

1.  substract

将E看做总体信号，将Eb看做背景信号，substract算法如下

E <- E - Eb

直接用总体信号减去背景信号

2. half

half 算法如下

E <- pmax(E - Eb, 0.5)

substract算法校正后的intensity可能为负数，为了避免负值的问题，half算法设置了一个阈值0.5， 当校正后的intensity小于0.5时，直接用0.5作为校正后的intensity。

3.  minimum

minimum算法如下

E <- E - Eb
for (slide in 1:ncol(E)) {
    i <- E[, slide] < 1e-18
    if