t-SNE 高维数据可视化

最近需要用到 PCA 和 t-SNE 降维技术,把 110 维的状态降到 2 维,用 matplotlib 可视化。

由于数据量比较大,加上 t-SNE 运行速度慢,所以先用 PCA 降到 50 维,再用 t-SNE 降到 2 维

from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.manifold import TSNE

# dataset_S.shape=(30000, 110)
pca = PCA(n_components=50)
pca.fit(dataset_S)
S_50d = pca.transform(dataset_S)  # (30000, 50)

tsne = TSNE(n_components=2, init='pca')
S_tsne = tsne.fit_transform(S_50d)  # (30000, 2)
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t-sne(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)数据是一种常用的降维算法,用于将数据映射到低维空间中,以便于数据的可展示。 在MATLAB中,我们可以使用已有的工具箱或自己编写程序来实现t-sne数据。以下是一种用MATLAB编写程序的示例: 1. 导入数据:首先,我们需要导入待处理的数据。可以使用`load`函数或其他读取数据的函数将数据加载到MATLAB中。 2. 数据预处理:针对不同的数据类型和目的,我们可能需要对数据进行预处理。例如,可以进行归一、去除异常值或缺失值等操作。 3. t-sne降维:接下来,使用`tSNE`函数进行降维。该函数可以设置不同的参数,如迭代次数、学习率、初始维度、输出维度等。例如,可以使用以下代码将数据降维到2维: ``` rng('default'); % 设置随机种子,保证结果可复现 tsne_result = tsne(data, 'NumDimensions', 2); ``` 4. 数据:最后,使用MATLAB的绘图函数将降维后的数据。常见的绘图函数包括`scatter`、`scatter3`、`plot`等。例如,可以使用以下代码将降维后的数据绘制成散点图: ``` scatter(tsne_result(:, 1), tsne_result(:, 2)); ``` 以上就是一个简单的t-sne数据MATLAB程序的示例。根据具体的数据和需求,可能需要进行更多的参数配置和绘图设置。使用MATLAB的这些基本步骤,可以轻松实现t-sne数据

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