生信豆芽菜-101种算法组合构建预后模型

最新推荐文章于 2024-11-02 10:09:29 发布
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文章标签： r语言 数据挖掘 数据分析 算法
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版权

网址：http://www.sxdyc.com/prognosticmodel
一、使用方法
1、数据准备
训练集表达数据
在这里插入图片描述

训练集生存数据
在这里插入图片描述

验证集表达数据
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验证集生存数据
在这里插入图片描述

2、选择两组颜色，提交等待运行结果即可
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二、结果
在这里插入图片描述
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当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据

在这里插入图片描述

木之如水
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论文研究 - 产后化脓性炎症疾病发展的预后模型
05-15
背景：目前，产后化脓性炎症疾病仍然是医学中的突出问题。 结果，许多科学出版物致力于找到解决该问题的方法。 这些解决方案主要包括优化基于抗生素的疾病预防和治疗的想法。 然而，不幸的是，这些病理的早期诊断和预后被忽视了。 研究的目的：建立产后化脓性炎症疾病发展的预后模型。 材料和方法：我们研究的主要重点是化脓性炎症疾病的早期诊断和预后方法的建立。 主要人群包括170名被诊断为化脓性炎症性疾病的妇女，而对照队列由40名妊娠过程简单的妇女组成。 使用荧光光谱法分析患者的血清。 此外，我们暗示在产后子宫内膜炎患者的临床和实验室检查中使用了多种标准化算法。 结果：研究了40名对照组妇女和170名主要妇女的荧光光谱。 基于使用荧光光谱仪获得的数据以及来自临床和实验室检查的数据（生殖器病理，妇科相关疾病，流产的风险，手术，TORCH感染，阴道炎，劳动时间> 12小时，劳动异常，最大血清荧光光谱）值，荧光光谱≤0.845，年龄，床天数，胎儿窘迫），我们得出了产后化脓性炎症疾病发展的预后模型。 结论：因此，我们基于主要的13个因素得出了一种预后模型，其有助于产后化脓性炎症疾病的发展。 确定该模型正确，概率
CCRCC+101 种机器学习算法组合+免疫原性死亡+单细胞
bioInfo_seeker的博客
04-27 1765
3、TCGA数据集ssGSEA计算ICD-score，并使用WGCNA的方法筛选关键的module基因集，同时差异分析筛选肿瘤发生相关的基因集，GO和KEGG富集分析筛选关键的功能。4、基于10种机器学习的方法构建101种机器学习算法组合构建风险模型，并择优选择c-index最佳的模型，其中在c-index相差不大的时候，基因数量越少越好，这里作者选择了lasso+逐步回归+多因素建模，并绘制KM曲线。8、风险模型的功能注释，GSE+GSVA，关键功能高低评分的KM曲线。低风险GSEA分析，和配受体分析。
rstudio跑不动咋整？-------生信豆芽菜
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04-13 858
我有时候在思考，这么一来配置的服务器，什么时候才可以回本，什么时候才可以盈利，在这个物欲横流的时代，让人不敢相信，后来，我详细了解了他们的平台，才发现，生信豆芽菜，是做数据挖掘起家，他们的公众号(生信豆芽菜)专门做文章复现，而且是纯代码复现的那种。我不是她，我也无法理解，她在做什么？我活着是为了什么呢？但是在她身上我看到了曾经的艰难，曾经为了学习所经历的一切，曾经的曾经，我们也是这样，在满怀希望和期待，我开始写CSDN，开始做技术共享，可是多年过去了，曾经的雄心早已不在，剩下的只有被生活抹去棱角的我！
生信质控分析-FastQC
01-13
**FastQC：生信质控分析的基石** FastQC是一款广泛应用于生物信息学领域的基础软件，专门用于对高通量测序数据进行质量控制（QC）分析。在高通量测序技术如Illumina、PacBio或ONT等产生的海量数据中，FastQC能够...
华中科技大学生信专业课件--基因芯片
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华中科技大学生信专业课件.基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列...
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富集分析是生物信息学中的一个关键步骤，用于探索在特定条件下基因集合的功能特性。在R语言中，富集分析提供了强大的工具来解析基因表达数据并揭示潜在的生物学意义。本教程将深入讲解如何利用R进行富集分析，这对于...
用R语言来生信分析_R-learning.zip
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R语言-GWAS全基因组关联分析结果整理算法-方法笔记
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【运动的＆足球】足球场地区域图像分割系统源码＆数据集全套：改进yolo11-RFAConv
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本项目数据集信息介绍本项目所使用的数据集名为“football boxes”，旨在为改进YOLOv11的足球场地区域图像分割系统提供支持。该数据集包含七个类别，分别为“18Yard Circle”、“18Yard”、“5Yard”、“First Half Central Circle”、“First Half Field”、“Second Half Central Circle”和“Second Half Field”。这些类别涵盖了足球场上不同的关键区域，为模型的训练提供了丰富的样本和多样化的场景。
NewStarCTF2024-Week4-Web-WP
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打算去改上周的脚本，结果去跑的时候忘了将上次的最后 payload 注释，直接就上周的脚本就跑出来 flag 了，week3 应该是打算考布尔盲注，week4 是时间盲注，所以直接就都打通了。最后 final.php 是一个反序列化的利用，一开始还想绕过过滤的 chocolate，后面发现不需要绕过，并且 url 编码后传入不行，直接传序列化后的内容。又看到另一个下载插件路径可控的，但是插件管理里面并没有看到可以下载插件的地方， 手动构造一下，但是似乎出不了网...
R语言机器学习算法实战系列（十五）随机森林生存预后模型+SHAP值 (Random Survival Forest + SHAP)
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大数据-198 数据挖掘 机器学习理论 - scikit-learn 归一化 距离的惩罚
永远好奇，无限进步！
10-30 2154
最近邻点距离远近修正在对未知分类过程中，一点一票的规则是 KNN 模型优化的一个重要步骤，也就是说，对于原始分类模型而言，在选取最近的 K 个元素之后，将参考这些点的所属类别，并对其进行简单计数，而在计数的过程中这些点一点一票，这些点每个点对分类目标点的分类过程中影响效力相同。但这实际上不公平的，就算是最近邻的 K 个点，每个点的分类目标点的距离仍然有远近之别，而近的点往往和目标分类点有更大的可能性属于同一类别（该假设也是 KNN 分类模型的基本假设）。真正正确的方式是，先分训练集和测试集，再归一化。
大数据-197 数据挖掘 机器学习理论 - scikit-learn 泛化能力 交叉验证
永远好奇，无限进步！
10-30 1720
在业务中，我们训练数据往往都是以往已经有的历史数据，但我们的测试数据却是新进入系统的数据，我们追求模型的效果，但是追求的是模型在未知数据集上的效果，在陌生的数据集上表现的能力被称为泛化能力，即我们追求的是模型的泛化能力。通常来说，我们认为经过验证集找出最终参数后的模型的泛化能力是增强了的，因此模型在未知数据（测试集）上的效果会更好，但尴尬的是，模型经过交叉验证在验证集上的调参之后，在测试集上的结果没有变好的情况时有发生。所有的交叉验证都是在分割训练集和测试集，只不过侧重的方向不同。
如何使用python轻松入手文本数据分析？
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如何有效地分析这些文本数据，提取有价值的信息，成为了数据科学领域的重要研究方向。Python作为一种强大的编程语言，凭借其丰富的库和工具，成为文本数据分析的热门选择。通过这些步骤，能够有效地从文本数据中提取有价值的信息。随着技术的不断发展，文本数据分析的应用场景也在不断扩展，未来将会有更多的研究和实践值得探索。以上是关于基于Python的文本数据分析的概述，涵盖了从数据收集到结果评估的各个方面。本文介绍了如何使用Python进行文本数据分析的基本流程，包括数据收集、预处理、特征提取、情感分析和主题建模等。
如何使用python完成时间序列的数据分析？
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时间序列是指在时间上有序的一组数据点。时间序列数据可以是定期收集的（如每日、每月、每年）或不定期收集的。时间序列的主要特征包括趋势、季节性、周期性和随机性。
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python如何完成金融领域的数据分析，思路以及常见的做法是什么？
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本文介绍了如何使用Python进行金融数据分析的基本流程，包括数据获取、数据处理、数据分析和数据可视化等方面。随着金融市场的复杂性和数据量的激增，传统的分析方法已无法满足需求。随着金融市场的不断发展，数据分析的重要性将愈加凸显，掌握Python数据分析技能将为金融从业者提供强大的竞争优势。通过以上内容，读者可以对如何使用Python进行金融数据分析有一个全面的了解，并能够在实际工作中应用这些技术。Python作为一种强大的编程语言，凭借其丰富的库和工具，成为金融数据分析的首选语言之一。
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