- 博客(5)
- 资源 (6)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 R语言数据降维
今天是2020年的最后一天，这一年多灾多难，让我们唏嘘不已。不论2020如何，生活仍要继续，希望即将到来的2021年，可以‘牛’转乾坤。这也是2020年的最后一篇博客了，在这里给大家介绍一下。目前R语言的几种降维方式。首先需要配置数据data<-matrix(rnorm(3000),ncol=6)colnames(data)=paste0('gene',1:6)rownames(data)=c(paste0(rep('C',nrow(data)/2),1:(nrow(data)/2)),
2020-12-31 13:47:19
4630
1
原创 R语言矩阵的转化
在使用R语言的过程中，我们会遇到很多问题，比如说长宽矩阵的转化，不能每一次都是手动处理，这样也很麻烦，实现长宽矩阵的转化的方式很多，我们只需要掌握其中一对就好。1、宽变长这里我随意设置一个矩阵，作为测试数据#测试数据的生成，10X10data=matrix(1:100,nrow=10)colnames(data)=paste0('sample',1:10)data=data.frame(gene_name=paste0('gene',1:10), data...
2020-12-25 13:24:08
8093
原创 linux安装R包的安装
首先在linux系统下，需要安装好R语言，由于依赖环境较多，一般会通过第三方软件库进行安装，比如说miniconda等R包分以下几种：镜像包：一般安装方式为：install.packages('')，选择合适的镜像进行安装bioconductor包：一般安装方式为github包，一般安装方式为：1、确定我们需要安装R包属于哪种？可以先默认用镜像安装的方式，如果出现报错，如下：说明limma包不是镜像包，这时候，可以进入bioconductor官网https://bioconductor.or
2020-12-25 13:23:32
3902
原创 ComplexHeatmap包绘制热图（二）
前面我介绍了如何利用ComplexHeatmap包绘制简单的热图，现在我们绘制一个稍微复杂一些的热图首先还是配置数据data=matrix(rnorm(100),nrow=10)colnames(data)=paste0('sample',1:10)rownames(data)=paste0('gene',1:10)head(data)准备另外一个数据anno_row=as.matrix(1:10)rownames(anno_row)=paste0('gene',1:10)colname
2020-12-09 20:27:01
2884
6
原创 ComplexHeatmap绘制热图（一）
讲起热图，大家都会比较熟悉，绘制热图方式比较多，这里介绍的是ComplexHeatmap包绘制热图，首先配置数据，这里的自动生成一个10X10的矩阵data=matrix(rnorm(100),nrow=10)colnames(data)=paste0('sample',1:10)rownames(data)=paste0('gene',1:10)head(data)加载R包library(ComplexHeatmap)Heatmap(data, col=c('blue','
2020-12-09 19:39:11
2543
2
spell_picture3.1
2020-12-11
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人