TwoSampleMR安装R包（devtools辅助从GitHub上安装R包）

最新推荐文章于 2025-03-25 23:10:59 发布

rainy bamboo

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文章标签： r语言 macos

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_44137875/article/details/119456708

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没有检索到摘要

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

参考链接：https://github.com/MRCIEU/TwoSampleMR

使用的是MacBook Air，以下指令在RStudio中输入。

在没有安装devtools的情况下，输入以下指令：

install.packages("devtools")
devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")

若是原先就已经安装好devtools，那就可以直接调用：

Library(“devtools")
install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")

或者直接输入：

devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")

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rainy bamboo

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从 Github 安装 R packages 不完全指南

生信学习

07-08

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R语言，一个被广泛使用的统计计算和数据分析工具。在日常使用过程中，需要安装实现各种功能、来自各种渠道的工具包（packages）比如：CRNA或者Github。很多包已经发布在 CRAN 上，使用就可以直接安装。但有时我们需要从 GitHub 安装，特别是一些最新或尚未发布到 CRAN 的工具。正好最近遇到个小问题，顺手记录一下。😑。

Centos7_miniconda_devtools安装_R语言入门之R包的安装

静宁宇思

04-22

1164

因为有同时反馈安装R包很慢或卡住。同事提供了一个安装R包的命令给我测试，在安装过程中复现报错信息，把下载慢或卡信的链接中的域名在防火墙中调整出口。

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记录一下TwoSampleMR安装

ACGTexplorer的博客

11-05

7418

虽然有些问题仍然没有解决，但是如果以后再遇到这种github包安装的时候可以借鉴相同思路。为什么要记录TwoSampleMR的安装过程呢？因为这个包足足安装了1个半小时。有帖子说可以用httr包修改代理，但我实在不懂代理是个啥，所有就放弃这个方法了。还是有一些没有解决的问题，比如。安装完依赖包后最后成功。

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记录下自己安装r时候的一些问题。（1）window下安装R的顺序为R、Rtools、RStudio。安装基本上都是默认下一步，未做太多修改，我是直接安装在了C盘的，担心出错，想来安装在D盘应该也不会错，不过没想尝试。R、Rtools、RStudio下载地址。 The Comprehensive R Archive Network （2）安装R包时候在RStudio中无论是输入 install.packages（'devtools'），或者是在 tool > Install Packag

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MRlap要求输入的GWAS summary data的A1和A2列必须为均为大写，所以需要转换一下，这个官网没介绍，一直出现报错后，才发现这个问题；另外，还有MRlap和LDSC一样，beta，和or值只能有一个，所以这里对数据中是否有OR值进行简单判断，如果有的话，将它改为其他的列名，就不会被识别了；由于MRlap内置的clump功能与twosampleMR一样，如果不使用本地，很难进行，虽然它官网提供了本地clump的功能，但是感觉应该是还没调试好，目前还是会报错，无法进行；

探索遗传因果关系：TwoSampleMR R包助力孟德尔随机化分析

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TwoSampleMR-R教程两样本孟德尔随机化（原来真的就是这么简单……）