安装lammps

安装lammps

安装centos7系统的时候对硬盘分区：/-50G /var-50G /boot-10G /home-150G /biosboot-2G /swp-64G

一：安装fftw：
1、在lammps文件夹下 mkdir fftw3
2、在解压后的文件夹fftw-3.3.8中输入

su(不然没法shared)
./configure --prefix=/home/hou/lammps/fftw3 --enable-shared=yes  （不shared不能建立lammps共享库）
make -j8
make install

二：安装mpich：
1、在lammps文件夹下 mkdir mpich3
2、在解压后的文件夹mpich-3.3中输入

./configure --prefix=/home/hou/lammps/mpich3 --enable-shared
make -j8
make install

三：设置fftw和mpich的环境变量：
1、在桌面中输入

vi .bashrc
i(插入)
在文件最后插入
export PATH=/home/hou/lammps/fftw3/bin:/home/hou/lammps/mpich3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/hou/lammps/fftw3/lib:/home/hou/lammps/mpich3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
Esc(退出编辑) 
:wq(退出文件)
source .bashrc(更新bashrc文件)
echo $PATH(验证)
mpirun -np 2 gedit(测试mpich)

四：安装lammps：
把lammps压缩包解压后的lammps-install文件夹复制到lammps文件夹下
进入lammps-install中的src中查找MAKE文件夹中的Makefile.mpi文件，修改编译器和路径，如下

把开头两个mpicxx换成g++

MPI_INC =       -DMPICH_SKIP_MPICXX -I/home/hou/lammps/mpich3/include
MPI_PATH =      -L/home/hou/lammps/mpich3/lib
MPI_LIB =	    -lmpich -lmpl -lpthread

FFT_INC =    	-DFFT_FFTW3 -I/home/hou/lammps/fftw3/include
FFT_PATH =         -L/home/hou/lammps/fftw3/lib
FFT_LIB =	       -lfftw3

修改后返回src文件夹中开始安装，输入下面的命令

make yes-all
make no-lib
make mpi -j8

设置环境变量：
在lammps-install文件夹下新建文件夹bin：mkdir bin
把src中生成的lmp_mpi复制到bin中
在桌面：

vi .bashrc
i
export PATH=/home/hou/lammps/lammps-install/bin:$PATH
Esc
:wq
source .bashrc
lmp_mpi

输入lmp_mpi可以看到版本号，说明设置成功

基本参考b站up 埃爱慕阿Super，链接为https://space.bilibili.com/389751075/