Materials Studio 计算溶解度参数

计算背景:

化学物质的溶解度参数在石油化工行业应用广泛。比如在油田化学领域,为了保护油层,防止聚合物油田化学剂可能引起的油层污染,因此在选择聚合物或者溶剂时,都应事先考虑它们的水溶性或酸可溶性,这就要求必需了解它们的溶解度参数。

化学物质溶解度参数是决定化学物质是否相容的重要因素,因而决定了它在油田化学领域中的重要性。获得化学物质溶解度参数的通常做法是查阅化学手册或者直接实验,然而,相当多的化学物质是化学手册中所没有的,而做实验既费时又费力,还消耗大量的实验经费。因此通过计算机模拟计算化学物质的溶解度参数来解决工业应用问题是一个非常好的选择。

主要步骤:

(1)利用Materials Studio(MS)或其他软件画出待计算化学物质的分子模型,使用Packmol进行盒子构建;

(2)MS的Forcite板块中的“结构优化”程序对步骤(1)中的结构进行多次计算,得到合理的优化结构;

(3)MS的Forcite板块中的“退火”程序模拟实际情况下的温度变化,松弛分子间相对位置,对步骤(2)中经能量最小化处理的数据结构文件进行进一步优化;

(4)MS的Forcite板块中的“动力学”程序对步骤(3)中所建立的待计算化学物质依次在NPT和NVT情况下进行合理时长的动力学优化,得到分子动力学轨迹文件;

(5)MS的Forcite板块中的“内聚能密度”程序分析上述动力学轨迹文件。计算完成后即可得到有溶解度参数的数据。

总结:

可将最后得到的结果相互对比,某些个物质在某一温度下溶解度参数相近,即为具有较好的相容性。实际实验中可将该物质在该温度下进行混合,理论上所得混合物在其他温度下具有更好的相容性。可在橡胶抗老化剂、石油助燃剂等行业中使用,对后续实验具有指导性意义。

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1.1量子力学方法 1.1.1 CASTEP CASTEP由Cambridge大学Mike Payne教授发布,采用密度泛函理论、平面波赝势法(用平面波描述外层价电子,内层电子用赝势代替),进行第一性原理量子力学计算的程序。其中总能量包含动能、静电能和交换关联能三部分,各部分能量都可以表示成密度的函数。电子与电子相互作用的交换和相关效应采用局域密度近似(LDA)或广义密度近似(GGA),静电势只考虑作用在系统价电子的有效势(即赝势:Ultrasoft 或norm-conserving),电子波函数用平面波基组扩展(基组数由Ecut-off确定),电子状态方程采用数值求解(积分点数由FFT mesh确定),电子气的密度由分子轨道波函数构造,分子轨道波函数采用原子轨道的线性组合(LCAO)构成。计算总能量采用SCF迭代。CASTEP在计算分子、固体、表面、界面、掺杂、错位等方面非常有优势。 主要功能及特性:  支持 PBE、PBE0、HSE03、HSE06以及SCAN meta-GGA 等交换关联泛函;  能量计算:形成能、吸附能、缺陷形成能、内聚能、表面能等;  结构优化:力与应力的计算、几何驰豫(原子坐标、晶胞参数、键长、键角、)等;  过渡态:过渡态搜索等;  电子结构:能带、态密度(局域、分波)、声子谱、电荷密度、差分电荷密度、电子局域函数、电子轨道、扫描隧道显微镜STM模拟、共价键级、静电势(支持可视化)、静电荷(Mulliken、Hirshfeld)、功函数、自旋极化(共线、非共线)、支持旋轨耦合、费米面、支持利用On-the-fly 生成模守恒(normconserving)赝势,特别适用于计算磁性材料和包含f电子的元素;  介电性质:波恩有效电荷、静态介电常数张量、极化率张量;  力学性质:弹性力常数张量,体模量,剪切模量,杨氏模量,泊松比;热力学性质:声子态密度、色散谱、熵、焓、自由能、零点能、德拜温度、等容热容随温度的变化曲线;  光学性质:红外光谱、拉曼光谱5.0、核磁共振谱(NMR CASTEP,可用DFT+U)、电子能量损失谱4.4(旋轨耦合效应5.5)、X射线吸收谱4.4(旋轨耦合效应5.5)、光频介电常数虚(实)部、吸收系数、折射率、能量损失函数、光导率虚(实)部;  动力学计算:支持NVE、NVT、NPT以及NPH等系综,以及多种控温控压函数;
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