ERROR: sequence and quality have different length:

在利用fastp或者trim-galore过滤fastq文件时报错，报错的问题在于reads的序列长度和序列质量的长度不匹配。检查fastq文件的md5编码，我发现每个样本的fastq2文件没问题，就fastq1有问题，真是太奇怪了。定位到fastq1中错误发生的reads上，发现reads后面的数据格式混乱 (标准的reads四行变为不规律的一堆序列和字符)，我猜测这是下载过程中网络问题导致的文件缺失。
解决方法一，如果仅仅是某几条reads出问题，确定出问题的reads的行数，直接删除就好。
解决方法二，如果是大量的格式错误，那就换一个数据下载方法，比如我用的Aspera下载的数据，换成ftp下载就解决这类错误了（感觉这东西看运气，我之前下载了几十个样本都没问题，就偏偏最近下载数据老出问题）。