VScode调试程序处理bam文件

需要对bam文件进行处理,于是自己编写程序,调用htslib库中的api。代码是在ubuntu中的vscode进行编译和调试,代码编写完成后,点击启动调试,选择调试环境,这里选择的是GDB/LLDB
在这里插入图片描述
之后会让你选择配置,选择gcc-生成和调试活动文件

在这里插入图片描述会在当前目录下生成.vscode文件夹,文件夹内会自动添加task.jsonlaunch.json文件,但是会出现报错。
在这里插入图片描述控制台上也会出现错误提示,这是因为未能正确加载htslib库。
在这里插入图片描述需要在task.jsonagrs输入参数,添加以下三行。

"-Ihtslib",
"-Lhtslib",
"-lhts"

在这里插入图片描述
还需要在launch.json的args中添加需要输入的文件名,之后便可以正常编译调试以及运行了。

  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值