应对生态环境挑战:BIOMOD2模型、MaxEnt模型、物种分布模拟、生物多样性生境模拟与保护优先区甄选、自然保护区布局优化评估等

本文介绍了如何使用R语言和MaxEnt模型进行物种分布模拟、参数优化,以及在生物多样性保护中的应用,包括自然保护区的布局优化、生境模拟和保护优先区甄选。通过实例和理论相结合,探讨了如何解决保护区存在的问题和提高保护效率。

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目录

①基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟

②基于R语言、MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作

③基于MAXENT模型的生物多样性生境模拟与保护优先区甄选、自然保护区布局优化评估

更多应用


针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题,科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。

①基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟

BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特定物种与其环境之间的关系,试图利用环境变量来模拟特定物种的生态位。

专题一 BIOMOD2模型概述
R平台下软件包的安装
软件包的功能、模型介绍
物种分布的基本原理
物种分布模型的发展、种类及评价方法
影响物种分布模型准确性的因素

专题二 BIOMOD2模型运行

1.物种分布文件的建立
数据获取的途径与方法
物种分布的确认与筛选
数据文件的格式

2.环境变量的选择
环境变量获取的途径与方法
环境变量的选择及处理方法
图层处理

3.模型参数及其设置
模型的训练、检验
权重设置
Pseudo-absences数据及设置

4.模型算法介绍及主要参数
模型包括: GLM、GBM、GAM、CTA、ANN、SRE、FDA、MARS、RF和MAXENT.Phillips

专题三 BIOMOD2模型运行结果的分析与解释
模型效果的评估
变量的贡献(重要性)
响应曲线

专题四 BIOMOD2模型的预测及分析
未来气候变化下的情景预测
物种适生区的变化、转化率等
MESS分析过程及实现

专题五 BIOMOD2模型的应用案例
基于单个模型算法(MAXENT)的案例
基于组合预测模型的应用案例
注:请提前自备电脑及安装所需软件


②基于R语言、MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作

第一章 理论篇以问题导入的方式,深入掌握原理基础
什么是MaxEnt模型?
MaxEnt模型的原理是什么?有哪些用途?
MaxEnt运行需要哪些输入文件?注意那些事项?
融合R语言的MaxEnt模型的优势?

第二章 常用数据检索与R语言自动化下载及可视化方法
常用数据下载网站(包括:气候、土壤、水文等,GBIF)
数据获取方法
1)手动下载
2)R语言命令行自动下载与可视化方法

 

第三章 R语言数据清洗与特征变量筛选
R、Rstudio安装
软件常用功能讲解
数据清洗的原理与实操练习
(清除数据库中缺少经纬度的数据、重复的数据)
利用相关性分析进行特征变量选择与实操练习

第四章 基于ArcGIS、R数据处理与进阶
ArcGIS安装
ArcGIS常用功能讲解与实践 
利用ArcGIS进行模型数据准备
进阶:基于R语言的数据准备

第五章 基于Maxent的物种分布建模与预测
Java、MaxEnt安装
模型界面说明
数据输入与变量设置讲解
输出结果分析

第六章 基于R语言的模型参数优化
敏感参数讲解
参数优化原理与实操练习
模型评价

第七章 物种分布模型结果分析与论文写作
物种分布特征分析
环境因素对物种分布的影响分析与制图
论文写作制图
注:请提前自备电脑及安装所需软件


③基于MAXENT模型的生物多样性生境模拟与保护优先区甄选、自然保护区布局优化评估

最大熵模型(Maxent模型)利用物种的分布与环境数据,采用特定算法评估物种的生态位,并投射到景观中,可以直观的呈现物种出现的概率、生境适宜度或物种丰富度等,是目前应用最广泛、预测效果最好的物种分布模型。采用基于Maxent模型的生物多样性热点模拟与GAP分析,将为我国的自然保护区优化、自然保护地体系构建和保护地社区精准脱贫致富等提供重要的决策依据。

专题一 生物多样性保护格局与自然保护区格局优化
1.我国生物多样性格局与分布
2.我国自然保护区格局与分布
3.自然保护区存在问题与及其原因分析
4.自然保护区格局优化与国家公园建设进展
5.自然保护区优化调整案例分享

专题二 生物多样性生境模拟基础技术操作一
1.ArcGIS概念、功能及其应用简介
2.ArcGIS软件安装
3.ArcGIS操作界面、辅助模块及其他辅助软件介绍
4.ArcGIS数据形式与数据格式、数据格式之间的相互转换
5.新地图要素的创建、数据加载、数据层操作与保存等
6.数据属性表的编辑与查询
7.投影/坐标系统基础
8.投影系统处理策略
9.投影系统的查看及转换方法

专题三 生物多样性生境模拟基础技术操作二
1.各种格式空间数据的剪裁、拼接及提取
2.矢量数据、删格数据的符号化
3.专题图制作
4.专题图版面设计、制图数据操作、地图标注、图幅整饰

专题四 生物多样性生境模拟高级技术操作一
1.图层运算与叠加分析方法
2.缓冲区分析技术
3.插值技术

专题五 生物多样性生境模拟高级技术操作二
1.基于DEM地理信息提取
2.图层运算与叠加
3.分区技术

专题六 Maxent模型介绍与数据收集
1.Maxent模型简介及安装
2.生物多样性数据的收集和预处理
3.影响生物多样性分布的自变量的收集和处理

专题七 Maxent模型输入参数处理及模型运行
1.Maxent模型输入参数处理
2.Maxent模型运行、输入与输出
3.Maxent模型的参数设置、优化

专题八 基于Maxent模型生物多样性热点模拟和保护区格局优化技术
1.Maxent模型的精度验证
2.Maxent模型结果解读、优化
3.基于Maxent模型的生物多样性热点区域呈现
4.基于Maxent模型的自然保护区格局优化方法

专题九 基于Marxan模型保护区优化与保护空缺甄选技术
1.Marxan模型的运行、输入和输出
2.Marxan模型的参数设置、优化
3.Marxan模型的精度验证
4.Marxan模型结果优化

专题十 Maxent模型在保护优先区甄选、自然保护区布局优化项目中的应用及论文写作
自然保护区的结构调整与布局优化,是“十四五”期间全国生物多样性保护、重要生态系统保护与修复的重要方向之一。由于历史原因,当前保护区普遍存在划定不科学、没有明确保护边界、未进行明确功能分区等问题,导致保护效率低下,表现为保护区范围与实际生物多样性热点分布存在保护空缺。

本教程将以实际案例详细讲解,在保护优先区甄选、自然保护区的结构调整与布局优化及其他相关项目中,(1)对区域生物多样性分布及生境进行评估,(2)甄选生物多样性热点分布区域,分析保护空缺,(3)最终得出项目区域的优先保护区规划体系与管理对策。

专题十一 Maxent模型在未来气候变化情景下自然保护区优化评估中的应用及论文写作
气候变化和人类活动共同影响未来生物多样性分布格局,自然保护区的结构调整和布局优化是一个动态而长期的过程。
本教程将以实际案例详细讲解,基于情景构建的分析方法,对未来可能发生的气候变化和人类活动进行模型模拟,进一步对未来各种因素影响下的生物多样性分布与保护区保护成效进行评估。针对气候变化和人类活动影响带来的不确定性,提出未来自然保护区建设的优化调整方向和适应性管理对策。

当前(左)和未来(右)生物多样性热点对比
​注:请提前自备电脑及安装所需软件


更多应用

包含:InVEST模型、PLUS模型、DNDC模型、APSIM模型、DSSAT模型、MAXENT模型、CENTURY模型、CASA模型、BGC模型、CLM模式、CESM模式、CLUE模型、FLUS模型、PROSAIL模型、Meta分析、BIOMOD2模型、物种气候生态位、物候提取、Python地球科学、Noah-MP陆面过程模型、CLUE模型、Fragstats景观格局分析、GEE遥感云大数据、Matlab/Python高光谱遥感、DICE模型、LEAP模型、双碳、ArcGIS、ArcGIS Pro等...

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