ggplot：火山图基因标注的包ggVolcano

最新推荐文章于 2023-02-25 15:58:04 发布

kylin王国

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分类专栏： R语言 ggplot 数据可视化文章标签： ggplot2

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library(ggVolcano)

## basic example code
# load the data
data(deg_data)

# use the function -- add_regulate to add a regulate column 
# to the DEG result data. 
data <- add_regulate(deg_data, log2FC_name = "log2FoldChange",
                     fdr_name = "padj",log2FC = 1, fdr = 0.05)

# plot
ggvolcano(data, x = "log2FoldChange", y = "padj",
          label = "row", label_number = 100, output = FALSE)