SEER公共数据库，最近一周有哪些新的论文？（9.6）

SEER（The Surveillance, Epidemiology, and End Results）数据库是由美国国立癌症研究所于 1973 年建立，是美国常用的癌症数据库，里面包括了各式各样的肿瘤类型，如肺癌、乳腺癌、胃癌等；还提供了各式各样的临床资料，如性别、年龄、TNM 分期等。

一、本周SEER文献预览

本周PubMed数据库“标题/摘要：SEER”搜索发现，本周发表62篇SEER论文

部分高分论文列表如下：

1.中国国学者文章介绍（一）

标题：使用经典统计学和机器学习的肺癌后第二原发癌患者的危险因素和预后列线图

背景：以前的研究表明，肺癌后患继发性原发性癌症（SPC）的风险增加。特别需要肺癌后SPC患者的预后预测模型来指导筛查。因此，我们使用经典统计学和机器学习对监测、流行病学和最终结果（SEER）数据库进行回顾性分析，以探索危险因素，并为肺癌后SPC患者构建新的总生存期（OS）预测列线图。

数据来源：从SEER数据库中收集了2000年至2016年肺癌后SPC患者的数据。

方法：肺癌后SPC的发病率通过标准化发病率（SIRs）计算。采用Cox比例风险回归、机器学习（ML）、Kaplan-Meier（KM）方法和对数秩检验，确定预测OS的重要预后因素。这些重要的预后因素用于开发OS预测列线图。

结果：总共有10，487个SPC样本被随机分为SEER数据库中的训练和验证队列（模型构建和内部验证）。在随机森林（RF）和极端梯度提升（XGBoost）特征重要性排名模型中，年龄是最重要的变量，这也反映在列线图中。而且，将机器学习与cox比例风险相结合的模型比仅使用cox比例风险的模型具有更好的预测性能（RF中的AUC = 0.762，XGBoost中的AUC = 0.737，COX中的AUC = 0.722）。校准曲线和决策曲线分析（DCA）曲线也表明，我们的列线图具有出色的临床实用性。基于网络的动态列线图计算器可在 https://httseer.shinyapps.io/DynNomapp/ 上访问。 

结论：系统评价肺癌后SPC的预后特征。我们构建的动态列线图可以提供生存预测，以帮助临床医生做出个性化决策。

2.中国学者文章介绍（二）

标题：开发和验证列线图以预测原发性肾上腺淋巴瘤的生存率：一项基于人群的回顾性研究

背景：虽然已知准确评估原发性肾上腺淋巴瘤 （PAL） 患者的总生存期 （OS） 和疾病特异性生存期 （DSS） 会影响其预后，但尚无稳定有效的预测模型。本研究旨在开发预测模型来评估生存率。

数据来源：这项研究从SEER计划中招募了5448名肾上腺肿块患者。

方法:使用最小绝对收缩和选择算子回归模型（LASSO）和精细和灰色模型（FGM）选择影响因素。此外，还构建了列线图。采用受试者工作特性曲线和自举自采样方法验证列线图的辨别性和一致性。采用LASSO和FGM选择PAL存活的独立影响因素，构建OS、DSS和FGS（FGM的DSS分析）模型3个模型。

结果：曲线下面积和决策曲线分析表明模型是有效的。

结论：本研究开发了生存预测模型来预测PAL患者的OS和DSS。FGS模型在短期内比DSS模型更准确。最重要的是，这些模型应该在治疗方式选择和生存评估方面为PAL患者提供益处。

3.中国学者文章介绍（三）

标题：预测类肺癌长期预后的竞争风险模型列线图

背景：对类肺癌长期癌症特异性生存的预测仍然存在争议。我们旨在通过使用竞争风险分析来预测类肺癌患者的长期癌症特异性生存，从而建立一个预后模型。

数据来源：监测、流行病学和最终结果（SEER）数据库。

方法: 回顾性地从SEER数据库中入组患者，收集临床病理资料。进行单变量和多变量竞争风险分析以确定预后因素。使用独立的预后因素建立了竞争风险模型和列线图。使用一致性指数和校准曲线对模型进行评估。

结果：共纳入2496例患者，其中267例（10.7%）死于确诊癌;316人（12.7%）因其他原因死亡。类癌患者的5年、10年和15年癌症特异性生存率分别为91.35%、86.60%和84.39%。多变量分析表明，年龄增加、男性、肿瘤较大、N分期较高、M1、非典型类癌、未接受手术是独立的危险因素。建立了基于风险因素的竞争风险模型和相应的列线图。自举调整后，开发模型的5年期、10年期和15年期模型的一致性指数在训练队列中分别为0.891、0.856、0.836，在验证队列中分别为0.876、0.841、0.819。5年、10年和15年的校准曲线显示出较好的一致性。

结论：年龄增长、男性、肿瘤体积较大、N期较高、M1、非典型类癌、未行手术等为独立危险因素。建立了预测长期生存率优异表现的竞争风险模型，并建立了列线图。

4.外国学者文章介绍（四）

标题：应用计算机文本挖掘算法对NCI护理模式研究中的医疗记录中的肿瘤突变状态进行过采样

背景和目的：国家癌症研究所（NCI）根据国会授权对选定的癌症部位进行护理模式（POC）研究。这些研究旨在收集超出NCI监测，流行病学和最终结果（SEER）计划通常收集的治疗信息。2019年的POC研究侧重于非小细胞肺癌（NSCLC）和黑色素瘤癌症部位。对于NSCLC病例，主要采样目标之一是对EGFR / ALK突变检测呈阳性的患者进行过度采样，但在选择研究样本之前无法获得突变测试结果的初始信息。

数据来源：监测、流行病学和最终结果（SEER） 。

方法:从SEER数据库中筛选所有符合条件的NSCLC病例。这些算法旨在识别突变测试状态，允许根据SEER注册表，性别，种族/民族和肿瘤突变测试结果进行分层抽样。

结果：最终的NSCLC样本包括2，434名年龄在20 +的晚期（IIIB-IVB）NSCLC 患者，分别在2017年和2018年诊断出来。在该样本中，692例（13.2%）的EGFR/ALK突变检测呈阳性。基于算法结果和医学图表抽象的已知EGFR / ALK状态的案例，对文本挖掘算法性能的评估显示出良好的结果：灵敏度为77.6%，特异性为90.8%，总体准确率为84.8%。

结论：在可访问电子病历的研究中，文本挖掘算法的适应性在对患有不常见病症的患者进行过采样方面证明是有效的。2019 年的 POC 研究为研究人员评估癌症治疗细节和患者特征提供了有价值的数据，尤其是在 EGFR/ALK 检测呈阳性的病例中。

5.外国学者文章介绍（五）

标题：粮食不安全对肝胆癌切除术后结局的影响

背景：粮食不安全（FI）可能使个人容易获得营养欠佳，导致慢性病和不良健康结果。我们试图评估县级FI对肝胆癌（HPB）切除术患者术后结局的影响。

数据来源：从监测，流行病学和最终结果（SEER）-Medicare数据库中确定2010年至2015年间被诊断为HPB癌症的患者。

方法: 年度县级FI数据来自《供养美国：绘制膳食差距图》报告，并被分类为三分位数。教科书结局定义为没有延长住院时间、围手术期并发症、90天再入院和90天死亡率。多元逻辑回归和Cox回归模型用于评估相对于FI的结局和生存率。

结果：在49，882例患者中（肝细胞：n = 11，937，23.9%;肝内胆管癌：n = 2111，4.2%;肝外胆管癌：n = 4047，8.1%;胆囊：n = 2853，5.7%;胰腺：n = 28，934，58.0%），6702例（13.4%）患者接受了手术切除。中位年龄为75岁（四分位距69-82），大多数患者为男性（n = 25，767，51.7%），自我认定为白人（n = 36，381，72.9%）。总体而言，分别有5291名（10.6%）和39，664名（79.5%）患者居住在低或中度FI县，而4927名（9.8%）患者居住在高FI县。教科书成果（TO）的实现率为56.3%（n = 6702）。在调整了竞争性危险因素后，居住在高FI县的患者达到TO的几率低于居住在低FI县的患者（比值比0.69，95%置信区间[CI] 0.54-0.88，p = 0.003）。此外，居住在中度和高FI县的患者在1-（指涉，低，中：风险比[HR] 1.09，95%CI 1.05-1.14;高：HR 1.14，95%CI 1.08-1.21），3-（指涉，低，中：HR 1.09，95%CI 1.05-1.14;高：HR 1.14，95%CI 1.08-1.21）和5-（指涉，低，中：HR 1.05， 95% 置信区间 1.01-1.09;高：HR 1.07，95% CI 1.02-1.13）年与来自低 FI 县的个人相比。

结论：FI与HPB恶性肿瘤切除术后围手术期不良结局和远期生存率相关。需要采取旨在减轻营养不平等的干预措施，以改善脆弱的HPB人群的结局。

6.外国学者文章介绍（六）

标题：临终胃肠道癌患者的种族/民族、持续贫困和阿片类药物获取的关联

背景：健康的社会决定因素（SDoH）会影响获得医疗保健的机会。我们试图评估临终（EOL）胃肠道癌症患者持续贫困（PP）、种族/民族和阿片类药物获取之间的关联。

数据来源：在2008年至2016年期间，在EOL附近发现了患有胃癌，肝癌，胰腺癌，胆道癌，结肠癌和直肠癌的SEER-Medicare患者。

方法: 在2008年至2016年期间，在EOL附近发现了患有胃癌，肝癌，胰腺癌，胆道癌，结肠癌和直肠癌的SEER-Medicare患者，定义为死亡或临终关怀登记前30天。数据与美国社区调查和美国农业部（2000-2015）的县级贫困有关。县被归类为从未高贫困（NHP），间歇性高贫困（IHP）和持续贫困（PP）。检查了阿片类药物处方填充和每日剂量（每天吗啡毫克当量）的趋势。

结果：在48，631名医疗保险受益人（肝脏：n = 6551，13.5%;胰腺：n = 13，559，27.9%;胃：n = 5486，1.3%;结直肠：n = 23，035，47.4%）中，EOL附近的阿片类药物处方稳步下降。黑人、亚洲人、西班牙裔和其他种族群体在EOL附近填写阿片类药物处方的几率显着降低（黑人：OR 0.84，95%CI 0.79-0.90;亚洲：OR 0.86，95% CI 0.79-0.94;西班牙裔：OR 0.90，95% CI 0.84-0.95;其他：OR 0.83，95% CI 0.74-0.93;所有 p < 0.05）。即使在填写阿片类药物处方后，这部分患者接受的日剂量也低于白人患者（黑人：-16.5个百分点，95%CI -21.2至-11.6;亚洲：-11.9 个百分点，95% 置信区间 -18.5 至 -4.9;西班牙裔：-19.1 个百分点，95% CI -23.5 至 -14.6;所有 p < 0.05）。在 IHP/PP 地区，亚洲、西班牙裔和其他种族群体的阿片类药物获取和平均每日剂量的差异有所减弱，但在黑人患者中加剧。

结论：EOL疼痛管理中基于种族/民族的差异持续存在，EOL阿片类药物使用中基于SDoH的变化。特别是，PP影响了EOL阿片类药物的获取和使用。

7.外国学者文章介绍（七）

标题：社会脆弱性与口腔癌生存、治疗和临床表现的关系

背景：本研究利用人口数据库调查社会环境如何与口腔鳞状细胞癌的诊断分期、多模式治疗和疾病特异性生存等结局相关。

数据来源：2007年至2016年监测、流行病学和最终结果（SEER）数据库。

方法: 对2007年至2016年监测、流行病学、最终结果（SEER）登记处的成人口腔鳞状细胞癌患者进行回顾性分析。CDC的社会脆弱性指数（SVI）用于描述县一级的社会脆弱性。使用Cox回归和逻辑回归确定疾病特异性生存期、诊断分期和多模式治疗使用的预测因素。

结果：我们的分析包括17 043名患者。在调整后的模型中，与最低四分位数（HR 1.24，95% CI 1.12-1.37，p < 0.001）相比，SVI 最高四分位数（最易感性）的患者表现出更差的疾病特异性生存率，并且更有可能在后期被诊断（OR 1.24，95% CI 1.11-1.38，p < 0.001），并且不太可能接受多模式治疗（OR 0.84，95% CI 0.77-0.99，p = 0.037）。

结论：高社会脆弱性与口腔癌患者更差的疾病特异性生存率和疾病表现有关。

8.外国学者文章介绍（八）

标题：睾丸癌幸存者中继发性恶性肿瘤 （SMN） 无生存期和 SMN 特异性生存期的危险因素和预测模型的鉴定

背景：本研究致力于确定睾丸癌幸存者中与继发性恶性肿瘤（SMN）相关的关键人口统计学和病理因素，并开发预测模型。

数据来源：监测、流行病学和最终结果（SEER）数据库（1975-2016）的53，309名睾丸癌患者。

方法: 测量的主要结局是无SMNs生存期，定义为从睾丸癌诊断到检测非睾丸恶性肿瘤的持续时间。次要结局是SMN特异性生存期，定义为从睾丸癌诊断到患者因SMN死亡的时期。

结果：在SEER队列的患者中，2978例（5.6%）发展为非睾丸癌SMN。年龄较大，接受化疗和放射治疗都与睾丸癌幸存者SMN的发生显着相关（均p <0.001）。Kaplan-Meier分析显示，接受放疗的患者无SMNs生存率较差，SMN特异性生存率较差（均p <0.001）。多变量Cox回归分析发现，非西班牙裔黑人种族、较高年龄、化疗和放疗与较差的无SMNs生存率显著相关（分别为p = 0.002，p < 0.001，p < 0.001和p < 0.001），而淋巴瘤组织学与更好的无SMN生存率相关（p < 0.001）。接受放射治疗的患者最常见的SMN类型是前列腺癌，肺癌和膀胱癌。开发了无SMNs生存期和SMNs特异性生存期的预测列线图，C指数分别为0.776和0.824。

结论：诊断年龄、非西班牙裔黑人、淋巴瘤组织学、化疗和放疗治疗史是SMNs无生存的预后因素。

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