在DrugBank上选药靶——孟德尔随机化
首先,找药靶必须得是DrugBank吗?
答:不是,人傻钱多有时间,花钱买药厂都行。像我这样的科研穷 狗只想白嫖 喜欢他家官网亮丽的紫罗兰!
所以。。。选她!选她!选她!
话不多说上链接
DrugBank官网:https://go.drugbank.com/
呐!就是这种 黛力新 的颜色 ↓
以官网让我看的Tylenol为例:
点进去看,怎么变成乙酰氨基酚了。百度说的Tylenol是泰诺啊!
Background里介绍了,这个药跟超过600种药物组成复方。所以,,,嗯,,,咱买到手的泰诺,这么取名字,有点。。。大气。。。另外就是某度不是专业搞药的(能看出我的委婉吗? )
网页左侧导航栏,查到Targets,显示有4个,4个都可以入组吗?
这个问题别问我,入组标准自己定的。如果知道答案了麻烦也告诉我一声(猥琐脸。。。):
红色框框就是靶点基因的名称啦。有没有注意到还有绿色框框?
Pharmacological action 为什么还区分 Yes or No?
查看官网说明:
翻译版:
DrugBank中包含的每种药物都有其数据保存在特定的药物卡或网页上。在每个药物卡上都有与卡的药物相互作用的靶标、酶、载体和转运蛋白相关的部分。添加到每个部分的每个[生物实体(bio entity)]在标题为“pharmacological action(药理作用)”的字段中都标记为“是”,“否”或“未知”。
- 如果卡的药物直接与[生物实体]相互作用作为其作用机制的一部分,则[生物实体]标记为“是”的药理作用。
- 如果与[生物实体]的相互作用不直接参与药物的作用机制,则标记为“否”。
- 如果目前没有正式的研究或证据来阐明与[生物实体]的相互作用是否与药物的作用机制有关,则药理作用被标记为“未知”。