基因名称类型

对于很多对基因进行记录的数据库而言，为了他们自己数据库记录的方便，对于每个基因都会进行自己数据库的唯一编号，这样就导致了一个基因形成了很多不同的编号(ID)。

EntrezID

        是Entrez 基因数据库（属于NCBI子数据库）的编号系统，Entrez 基因数据库是一个整合了核酸、蛋白、基因组等生物信息的检索库。EntrezID格式为一串数字，是目前最权威的基因编号，GO分析和KEGG分析一般输入的基因名格式一般都是EntrezID。

SymbolID

        Gene Symbol是用来表示基因的编码, 由大写字母构成, 或由大写字母和数字构成。如: GLA "galactosidase, alpha"; GLB "galactosidase, beta"。物种来源于人的，由HGNC（人类基因命名委员会）命名。

EnsemblID

        EnsemblID的结构是根据不同物种设置的前缀, 加上数据所指的类型, 如基因蛋白质, 再加上一系列的数字. 有的时候可以有不同的版本, 则在 Ensembl ID 后面加上小数点和版本号。其命名规则包含五个部分，ENS前缀，提醒我们该命名来源于Ensembl ID，第二部分物种的前缀，第三部分Object type，G就是基因，P指蛋白，第四部分，identifier，是一段特定的数字，第五部分，版本号。

 

Uniprot ID

        如果我们查找的是一个基因的蛋白的话，那么就有可能涉及到Uniprot这种专门注释蛋白的数据库。这种ID有时候会在蛋白组学当中看到。

R语言实现ID的转换（以simbolID转为EntrezID为例）

library(clusterProfiler)

library(org.Hs.eg.db)

geneID <- bitr(genes$genes, fromType = "SYMBOL",toType = c( "ENTREZID"),OrgDb = org.Hs.eg.db ,drop = T)