MRtrix3 安装

MRtrix3 安装与使用

MRtrix3 是一个强大的工具，用于处理 DWI（弥散加权成像）数据，可以高效计算 FOD（纤维方向分布） 并进行可视化。

1. 安装 MRtrix3

(1) 安装前置依赖

在 Linux (Ubuntu) 或 macOS 上，先安装以下依赖：

sudo apt update
sudo apt install -y git g++ python3-pip python3-numpy python3-matplotlib \
    libeigen3-dev zlib1g-dev libqt5svg5-dev libfftw3-dev \
    libtiff5-dev libpng-dev libglib2.0-dev libqt5opengl5-dev \
    qtbase5-dev

(2) 下载 MRtrix3

git clone https://github.com/MRtrix3/mrtrix3.git
cd mrtrix3

(3) 编译 MRtrix3

./configure
./build

如果一切正常，你应该能运行：

./bin/mrview

如果显示 MRtrix3 GUI 界面，说明安装成功！

(4) 添加环境变量

echo 'export PATH=$HOME/mrtrix3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc