Tasks Assessing Protein Embeddings (TAPE)

已于 2023-02-03 12:40:51 修改
阅读量278 收藏
点赞数
分类专栏： 代码解析 文章标签： 深度学习 人工智能
于 2023-02-02 15:08:52 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_52812620/article/details/128850788
版权
_森罗万象
关注
专栏目录
深度学习论文: Learning to Resize Images for Computer Vision Tasks及其PyTorch实现
mingo_敏
01-10 2421
深度学习论文: Learning to Resize Images for Computer Vision Tasks及其PyTorch实现 Learning to Resize Images for Computer Vision Tasks PDF: https://arxiv.org/pdf/2103.09950.pdf PyTorch代码: https://github.com/shanglianlm0525/CvPytorch PyTorch代码: https://github.com/shang
LaTeX的tasks宏包
appmathw的专栏
06-11 2028
tasks 宏包 LaTeX的列表(list)通常是将项(item,条目)一个一个垂直的平行显示，所谓“列”表的由来。 水平分列列表，即将多个项分散到各列而不是一列，在出考卷的选择题时常碰到，LaTeX中的包有：enumcols(enumlists)、tasks(exsheets) enumcols宏包是李清创建的，TeXlive 2018后，与CTeX的模板冲突。本篇主要讨论tasks宏包的使用...
TAPE: 任务评估蛋白嵌入(Tasks Assessing Protein Embeddings)
gitblog_00014的博客
06-01 364
TAPE: 任务评估蛋白嵌入(Tasks Assessing Protein Embeddings) tape-neurips2019 Tasks Assessing Protein Embeddings (TAPE), a set of five biologically relevant semi-supervise...
探索蛋白质嵌入的强大工具：TAPE
gitblog_00889的博客
09-13 1009
探索蛋白质嵌入的强大工具：TAPE tape-neurips2019 Tasks Assessing Protein Embeddings (TAPE), a set of five biologically relevant semi-supervised learning tasks spread across di...
ICLR2021 | 利用数据扩充提高蛋白质序列模型的通用性
DrugAI
11-28 1436
今天给大家介绍投稿在ICLR2021上的一项工作。由于蛋白质序列上的微小改变可能导致其功能上难以预测的变化，所以蛋白质序列往往无法使用类似于计算机视觉或自然语言处理中所使用的随机数据扩充方法。针对以上问题，作者从经验上探索了一组简单的字符串操作，当微调半监督蛋白质模型时，可使用这些操作来增加蛋白质序列数据。在TAPE baseline上的结果表明，对比学习微调方法优于mask token预测微调方法，随着数据扩充量的增加，对比学习方法的性能随之提高。当使用域驱动的转化以及将Transformer的...
探索蛋白质嵌入的新前沿：TAPE开源项目推荐
gitblog_00003的博客
04-15 250
探索蛋白质嵌入的新前沿：TAPE开源项目推荐 tape 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/tape6/tape 项目介绍 Tasks Assessing Protei...
阅读笔记--TAPE--NIPS2019
tn520520的博客
12-18 1267
阅读笔记蛋白质介绍蛋白质的基础问题蛋白质家族概要方法数据集 蛋白质介绍 蛋白质对于生物的运转必不可少，从运输氧气的血红蛋白到人眼中的感光蛋白，从运输离子的输运蛋白到肌肉中的肌肉蛋白，它们的存在为生命造就多姿多彩的发展。理解蛋白质的结构和损坏机理不仅能够让我们对疾病的分子学机理有着更好的了解，更能帮助我们找到更好的方式对抗疾病！蛋白质除了是维生的必要物质，更是生产各种抗体和疫苗的有效方式，同时还可以通过个性化改造让细菌具有分解废物的能力，生产出具有去污功效的酶。如果能够更深入地理解蛋白质，更多的新功能就可以被
NeurIPS TAPE | 用于评估蛋白质表示学习性能的多任务平台
DrugAI
12-14 1992
作者 | 黎龙光单位 | 湖南大学研究方向 | 蛋白质表示学习今天给大家介绍一篇加州大学伯克利分校研究人员发表在NeurlIPS2019上的一篇文章“Evaluating Protein...
A Survey on Contextual Embeddings.pdf
10-30
contextual embedding 综述 Contextual embeddings, such as ELMo and BERT, move beyond global word represen- tations like Word2Vec and achieve ground- breaking performance on a wide range of natu- ral ...
A unified context assessing model for object categorization
02-20
Abstract<BR>In this paper, we investigate how to appropriately use contextual information<BR>for object categorization tasks, especially in the statistical bag-of-features(BoF) framework. Our main ...
Dynamic Meta-Embeddings for Improved Sentence Representations.pdf
03-29
While one of the first steps in many NLP systems is ...class on a variety of tasks. We subsequently show how the technique can be used to shed new light on the usage of word embeddings in NLP systems
基于OpenFOAM和深度学习驱动的流体力学计算与应用
2301_80236428的博客
11-14 696
从物理模型融合到复杂流动模拟，从数据驱动研究到流场智能分析，深度学习正以前所未有的力量重塑流体力学领域。伴随深度学习在流体力学研究中应用的普及，相关的开源软件和工具为科研人员提供了便捷的平台，简化了深度学习模型的实现与应用过程，加速了研究成果的转化。深度学习架构能够有效从流体数据中抽取关键特征，应用于流场预测、流动优化、流场可视化等多个领域，极大地提升了流体问题的分析效率和精度。构建物理增强的深度学习模型，将流体力学的控制方程、边界条件等物理规则内嵌于模型中，以提高模型的准确性和物理一致性。
2024 - 超火的多模态深度学习公共数据纯生信5+思路分享
最新发布
itwangyang520的博客
11-17 335
研究通过决策曲线（DCA）分析也观察到所有队列中，与基于病理的生存模型、基因特征和单独的病理特征相比，DeepClinMed-PGM模型性能始终更优越（图2G-I），这一结果强调了DeepClinMed-PGM模型在早期DFS预测中的重要临床价值。**首先为了评估临床特征对乳腺癌患者DFS的预测作用，研究在训练和试验队列进行了单因素回归分析，结果发现年龄、分期、T分期和N分期等临床特征不能独立预测乳腺癌患者的DFS，而多模态风险评分在训练和试验队列中都是更有效的预测因子（图5A-B ）。
基于YOLOv8深度学习的智慧农业野生蓝莓成熟度小目标检测系统研究与实现(PyQt5界面+数据集+训练代码)
ZSW1218的博客
11-17 512
随着智慧农业技术的不断进步，传统农业逐渐向自动化、智能化转型，特别是在果实成熟度检测领域，精确、及时的检测手段已成为提升农业生产效率和优化资源配置的重要工具。
深度学习：利用随机数据更快地测试一个新的模型在自己数据格式很复杂的时候
weixin_44162814的博客
11-14 329
比如下面一个，我自己的数据很复杂，这里在代码最后用，两分钟就完成了代码的测试成功。
深度学习的艺术：揭秘卷积神经网络（CNN）的神秘面纱
码途探索
11-14 973
卷积神经网络以其在图像和音频处理上的优势，已经成为深度学习领域的一个重要分支。随着技术的发展，CNN将在更多领域展现其潜力。
循环神经网络（RNN）全面解析
hello.reader
11-13 1327
循环神经网络（Recurrent Neural Network, RNN）是一类用于处理序列数据的神经网络模型。RNN的关键特性在于其递归结构，可以在时间序列中记住之前的数据，从而适用于时间序列预测、自然语言处理（NLP）、语音识别等场景。RNN通过在序列中的每个时间步（Timestep）上共享参数，实现了序列数据的高效处理。RNN之所以适合处理序列数据，是因为它具有 “记忆” 功能，能够将前一步的输出作为输入传递给下一步。
基于卷积神经网络的航空发动机剩余寿命预测Matlab实现
2401_88845856的博客
11-14 1162
本文利用NASA提供的涡扇发动机退化数据集，进行数据预处理，构建训练样本和测试样本，然后搭建卷积神经网络（Convolutional Neural Network,CNN），学习训练数据，最后利用测试数据，分析神经网络模型预测剩余使用寿命（Remaining useful life，RUL）的效果。
layout feature embeddings
04-03
Layout feature embeddings are a type of representation used in computer vision and machine learning algorithms to capture the spatial layout of objects in an image. The idea is to encode information about the position, orientation, and size of each object in the image using a set of features that can be learned from data. One common approach to creating layout feature embeddings is to use a convolutional neural network (CNN) to extract features from the image, and then map these features to a set of layout embeddings using a separate network. The layout embeddings can then be used as input to downstream tasks such as object detection, segmentation, or classification. There are several benefits to using layout feature embeddings. First, they can help to capture complex spatial relationships between objects in an image that might be difficult to represent using traditional feature representations. Second, they can be learned directly from data, which means that they can adapt to different types of images and tasks. Finally, they can be used to improve the accuracy and efficiency of many computer vision tasks, by providing a more informative and compact representation of the underlying image.
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

_森罗万象

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值