单细胞多组学(RNA + ATAC)联合分析的智慧

本文探讨了单细胞RNA + ATAC联合分析在多个研究中的应用,指出初始阶段利用RNA注释ATAC数据,而在细胞亚群分析时进行联合分析,以揭示细胞类型特异性的分子变化。分析目的包括理解疾病状态下的细胞差异和功能转变。
摘要由CSDN通过智能技术生成
作者,Evil Genius
周五了,一周又过去了,时光匆匆,珍惜当下。
这一篇来分享一些关于单细胞RNA + ATAC联合分析的细节问题。
在发表于nature的文章Spatial multi-omic map of human myocardial infarction中,关于单细胞RNA和ATAC的分析是这样的。
组学数据一开始分开整合分析,snRNA的注释结果来辅助注释ATAC数据。

图片.png

但是在细分某个细胞类型的时候,却是RNA 与ATAC数据直接联合分析(展示在一张UMAP图上),

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