2025年单细胞空间系列课程

2025年的培训马上就要开始了~~~~
课表如下:
第一课:单细胞多样本基础分析梳理
第二课:单细胞亚群注释与个性化分析梳理
第三课:10X visium(Stereo-seq bin > 50) 多样本基础分析梳理
第四课:单细胞空间联合分析(RCTD、cell2location、iStar、spotiphy)
第五课:10X visium(Stereo-seq bin > 50)多样本细胞niche与注释
第六课:10X visium(Stereo-seq bin > 50) 空间转录组(单样本/多样本)共定位分析
第七课:10X visium(Stereo-seq bin > 50) 空间通讯分析
第八课:10X visium(Stereo-seq bin > 50)空间CNV分析
第九课:10X visium(Stereo-seq bin > 50)hotspot分析
第十课:10X visium(Stereo-seq bin > 50)细胞轨迹分析
第11课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)基础分析梳理
第12课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)依据邻域识别空间域与多样本整合
第13课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)空间注释
第14课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)细胞niche分析
第15课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)共定位与邻域分析
第16课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)细胞邻域差异富集分析
第17课:10X HD (Stereo-seq bin < 50、slide-seq)通讯分析
第18课:关于10X HD (Stereo-seq bin < 50)个性化分析的讨论(CNV、轨迹、NMF等)
第19课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)基础分析梳理与细胞网络
第20课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)依据邻域空间聚类与数据增强
第21课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)RCN(Recurrent cellular neighborhoods)分析
第22课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)细胞邻域与共定位
第23课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)细胞邻域差异分析
第24课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)依据微环境区分细胞亚型
第25课:Xenium(CosMx、IMC等高精度平台)细胞邻域通讯分析
第26课:CODEX基础分析梳理
第27课:CODEX数据CN聚类
第28课:CODEX数据邻域相关内容分析
大致课程如上,可能有1~2节课的波动,对于过去课程讲过的内容,重点部分我们进行复习,没有更新的就不多讲了,有更新的话我们补充一下。
初步计划6月21号开始上第一课。
2025学员会在课前拉一个微信群,把一部分近一年总结的一些分析资料、脚本发群里,供大家课前学习。
报名链接2025年单细胞空间系列课程
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