R中pheatmap画图一直报错Error in if (!(names(annotation)[i] %in% names(annotation_colors))) { : argument

最新推荐文章于 2023-09-08 16:21:35 发布
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分类专栏： 报错 R语言 文章标签： java 开发语言
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> pheatmap(cellratio,show_colnames=T,show_rownames=T,annotation_row = annotation_row,annotation_colors = ann_colors)#,annotation_colors=ann_colors)
Error in if (!(names(annotation)[i] %in% names(annotation_colors))) { : 
  argument is of length zero

查看annotation_row类型，发现不是data.frame，改后成功

> class(annotation_row)
[1] "matrix" "array"
> annotation_row=as.data.frame(annotation_row)
> pheatmap(cellratio,show_colnames=T,show_rownames=T,annotation_row = annotation_row,annotation_colors = ann_colors)#,annotation_colors=ann_colors)
>

小羊小羊，遇事不难
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