mafft的下载

最新推荐文章于 2024-03-02 20:49:52 发布
最新推荐文章于 2024-03-02 20:49:52 发布
阅读量1.2k 收藏
点赞数
分类专栏： mafft 文章标签： linux
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_55255016/article/details/119575402
版权

mafft用于序列比对分析

conda search mafft
conda install mafft
mafft --thread 16 input.fasta > output.fasta

出来的结果就是比对后的序列

任性的小姑凉
关注
专栏目录
多序列比对要多久时间_使用 MAFFT 进行多序列比对
weixin_31080717的博客
12-31 1499
1. MAFFT 简介最经典和广为熟知的多序列比对软件是 clustalw 。 但是现有的多序列比对软件较多，有文献报道：比对速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee)，比对准确性(MAFFT>Muscle>T-Coffee>ClustalW)。因此，推荐使用 MAFFT 软件进行多序列比对。2. MAFFT 下载安装$ wget ht...
MAFFT多重序列比对--(附比对彩标方法)
Tsingke
06-21 2996
[转记]MAFFT多重序列比对图解教程 【絮语】 　　一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee），还是比对准确性...
mafft-7.149-win64.zip
10-04
生信必备序列比对，以及建立系统发育树软件，功能强大，同时也是PCR可用软件，能同时帮助你比对多条序列，找出多条序列当中的保守区，有助于手动设计PCR引物
MAFFT安装及使用-mafft v7.520（bioinfomatics tools-004）
weixin_44874487的博客
03-02 5177
多序列比对是生物信息学的一个重要研究内容,比对结果高度依赖于比对工具的参数设置,包括空位罚分(GOP和GEP)以及替换矩阵。MAFFT多序列比对解决了这个问题。
clustal多序列比对汉化版
10-06
一个很不错的DNA序列分析软件，集序列比对、进化树构建于一身。
mafft|多序列比对工具
qq_50637636的博客
09-10 5161
1.利用conda安装mafft conda create -n mafft conda install mafft 2.进入mafft环境中 conda activate mafft 3.查看mafft版本号，确认是否安装好了 mafft --version v7.487 (2021/Jul/25) 4.运行mafft mafft in.fas > out.fas
MAFFT多重序列比对图解教程
立身以力学为先，力学以读书为本。 —郑耕老《劝学》
10-20 1万+
【絮语】 　　一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee），还是比对准确性（MAFFT>Muscle>T-Coffee>ClustalW）来说，其相比于ClustalW（或ClustalX）有过之而无不及，所
如何安装多序列比对软件MAFFT
最新发布
10-12
访问MAFFT官网 (https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/) 下载最新版本的源码包，例如`mafft-linsi.x.x.tar.gz`。 4. **解压并进入目录**: ```bash tar -zxvf mafft-linsi.x.x.tar.gz cd mafft-linsi.x.x ...
oracle 前导列_详解Oracle数据库中序列的使用及RAC中的Sequence Cache问题
weixin_39625172的博客
10-22 253
概述所谓序列，在oracle中就是一个对象，这个对象用来提供一个有序的数据列，这个有序的数据列的值都不重复。序列(Sequence)是用来生成连续的整数数据的对象，常常用来作为主键中增长列，序列中的可以升序生成，也可以降序生成。语法结构：创建序列CREATE SEQUENCE sequence_name[START WITH num][INCREMENT BY increment][MAXVALU...
Anaconda的安装、配置与使用conda安装软件
jianhunhenbaqi的博客
10-26 1万+
利用conda快速安装软件 安装软件与使用软件是计算生物学需要掌握的技能，大部分的软件都是命令行软件。早先的时候安装软件特别麻烦，现在出了很多自动安装软件的框架，例如conda。起初这个框架只是为了方便安装Python 版本与Packages，但是后来无论是C/C++或者R 之类的运行环境也都能安装了。它有一些已经打包好的安装了各种软件的发行版，例如Anaconda。 1.安装conda 可以去anaconda官网下载最新版本，或者去镜像源站下载anaconda的历史稳定版本，也可以安装更小型的minico
Conda及常用生信软件安装
invalidsyntax的博客
10-24 2410
1 Conda安装 1.1 Conda介绍 Conda是一种开源的软件包和环境管理软件，用于安装和转换不同版本的软件包及环境。其专为Python设计，可用于Mac、Linux和Windows系统。 Conda有两个主要的版本，Anaconda和Miniconda，前者包含一些常用软件包，后者是精简版，根据需要安装软件包。考虑到用于生信工作一些常用包反而可能并不常用，我个人建议下载精简版。 Miniconda下载地址：https://conda.io/minicond...
生信软件安装手册
班婕妤
03-11 1975
conda分为anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包的版本，miniconda则是精简版，需要啥装啥，所以推荐使用miniconda。InterPro是一个数据库，其提供蛋白序列的功能分析并归纳为一个个蛋白家族，同时还预测了presence of domains和important sites。为了将蛋白分类，InterPro使用先验模型，整合了不同的数据库形成一个整体 而InterProScan则是一款可以使用InterPro数据库的软件。
linux系统安装tomcat
weixin_63331779的博客
11-12 312
linux系统安装tomcat以及网页不能显示
生物信息软件安装（不定时更新）
david10251025的博客
12-24 2118
(以本地电脑wsl子系统的unbantu为例) 软件安装 anaconda安装与配置 下载Anaconda 2.7 for Linux https://www.anaconda.com/download/ 在下载目录下输入 bash Anaconda2-2.2.1-Linux-x86_64.sh #安装Anaconda 点yes往下后，输入查看是否安装成功 python -...
构建系统发育树~序列对比 MEGA、MAFFT（图文教程）
weixin_62735625的博客
01-15 1万+
前言 构建进化树的流程为：整合各个基因文件到一个fasta文件中→进行序列对比→建树。序列对比是构建进化树的基础，主要是为了确定所有序列的同源位点能相互对应。 一、MEGA进行序列对比 刚开始最先使用的序列对比软件是MEGA7.0，首先点击Align→Edit/Build Alignment，会弹出一个对话框，点OK，弹出第二个对话框，根据自己的序列选择，我选择DNA序列 会弹出另一个对话框，点击Edit→Insert Sequence From File ，打开自己整合后的fas...
几个多序列比对软件：Muscle,ClustalW和T-coffee的简单比较
热门推荐
悠悠的博客
12-01 4万+
几个多序列比对软件：Muscle,ClustalW和T-coffee的简单比较 转自：https://www.plob.org/article/4104.html ClustalW是现在用的最广和最经典的多序列比对软件, Muscle是速度最快的多序列比对之一,T-coffee是越来越受到欢迎的软件.它们各自有什么优点和缺点呢? ClustalW不仅可以用来做多序列比对,也能
不同版本的linux使用什么系统,Linux系统各个版本具体应用场景!
weixin_35775807的博客
04-29 275
Linux是非常热门的技术，随着应用领域不断拓展，越来越多的人都想要加入Linux行业中，当我们进入行业确定好自己发展路线之后，就是选择一个合适的Linux版本，但是对于很多人都是比较头疼的问题，Linux各个版本应用在哪些场景?为大家介绍一下。如果你是一个Linux爱好者，想要选择一个桌面系统，但是不想用盗版，有不少话费太多钱，可以选择Ubuntu桌面系统。如果你需要服务器端的Linux系统，用...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值