基于深度学习的药物−靶标相互作用预测研究综述

摘要: 新药物研发是一项耗时、耗力、耗资的复杂工程，整体成功率低于10%。药物−靶标相互作用预测是药物筛选和药物重定位的关键环节。准确的药物−靶标相互作用预测可有效缩小候选药物分子筛选范围，加速药物研发进程。传统实验方法研究药物−靶标相互作用耗时长、成本高且伴有一定的盲目性，难以进行大规模的药物−靶标相互作用识别工作。近年来，将机器学习尤其是深度学习技术用于药物−靶标相互作用预测成为主流研究。尽管在过去10年有大量的研究工作纷纷涌现，药物−靶标相互作用预测仍然是物质密集型和长期性的工作，对研究者来说仍具有挑战性。本文梳理近年来基于深度学习的药物−靶标相互作用预测研究工作，归纳总结现有工作的研究方法、评价指标和使用的数据资源，分析现有工作的不足并提出展望。本文的研究目的是帮助药物研发领域研究者全面了解深度学习在药物−靶标相互作用预测领域的最新研究进展，从而提高研究效率和研究质量。

• 关键词: 
• 药物−靶标相互作用  /  
• 人工智能  /  
• 机器学习  /  
• 深度学习  /  
• 药物研发  /  
• 图神经网络  /  
• 异质网络  /  
• 表征学习  

药物研发历史悠久，在史前时期便已存在[1]。时至今日，药物研发仍是一项不断实验，反复试错的过程。在20世纪