目录
1、GEO数据检索:
GEO Profiles以基因为单位,存储基因在数据集中的表达谱;
GEO DataSets以数据集为单位,储存同一个实验中的数据。
2、GEO数据类型
①Series数据集:将构成某个实验的相关样本集中到一个有生物意义的数据集,包括实验设计、描述、组别和样本等信息以及检测数据文件,以“GSE”开头,如GSE5764
②Samples样本:指实验中的样本,包括样本名称、类型、样本处理方案等信息及样本对应的检测数据,每个样本分配一个编号,以 “GSM”开头,如GSM134584
③Platform平台:指高通量实验检测所用的工具(哪个公司的哪一款产品),包括平台名称、描述、阵列注释等信息和文件,不同研究 者做的不同实验有可能使用的是同一种平台,平台的编号以“GPL”开头,如GPL570
3、数据下载
①Series页面下载:
首页-Series-筛选人体,数组表达式、甲状腺癌
(1) Series数据下载
(2)Platform数据下载
(3)Samples数据下载(可选择若干个单独下载)