常见生物遗传密码子的简并碱基

根据密码子的兼并性,常用一个符号代替某两个或者更多碱基。例如，编译丙氨酸的可以有4个密码子：GCU\GCC\GCA\GCG,这时生物学上为了方便，用字母N指代UCAG四个碱基，故说编译丙氨酸的密码子是GCN，其中N就是简并碱基。 通常生物学上根据蛋白质序列设计引物进行对应DNA克隆时，由于密码子的兼并性，对设计的引物上的某些碱基就会用简并碱基标示，在合成时各种碱基等量分配，也就是说，合成的简并引物是很多种引物的集合，其区别就在于简并碱基。简并度：简并引物的种类数，等于该简并引物内所有简并碱基的简并个数之积，即共有多少种不同的引物，其中只有一条是真正可以和模板配对的。

这是碱基的单字母命名方法,全部的对应关系如下：
B = C or G or T
D = A or G or T 
H = A or C or T 
K = G or T 
M = A or C 
N = A or C or G or T 
R = A or G 
S = C or G 
V = A or C or G 
W = A or T 
Y = C or T

 

简并碱基	正常碱基
R