我们想计算某物种所有基因的长度。
解决方案
网站:UseGalaxy.CN
工具:
Gene length and GC content from GTF and FASTA file(Galaxy Version 0.1.2)
Select a built-in GTF file or one from your history:Use a GTF from history
Select a GTF file: 基因注释文件(GTF格式)
讨论
为了计算基因长度,该工具在合并来自不同转录本的重叠外显子后,计算基因所有外显子中的碱基数量。
关于简说基因
生信平台
Galaxy中国(UseGalaxy.cn)致力于打造中国人的云上生物信息基础设施。大量在线工具免费使用。无需安装,用完即走。活跃的用户社区,随时交流使用心得。
生信培训
简说基因的生信培训班,荣获学员的一致好评。如果你也对生物信息学感兴趣,欢迎来跟简说基因,学真生信。
生信分析
我们能够承接所有 NGS 组学数据分析业务,包括但不限于 WGS / WES / RNA-seq 等。基因组组装、注释,以及各种重测序业务都可以与简说基因合作。