导语
前前后后找了不少方法途径,最后还是“通过充值解决问题”。使用奶牛快传来分发 TBtools 软件以及相关数据库,可以确保每个人都快速获得文件,经过国内国外多地多点测试,一般速度可以有 3Mb/s 以上。后续所有 TBtools 相关文件,都会通过这一通道提供。
软件快速下载通道
通过奶牛快传下载,打开链接可以看到(注意,数字越大,版本就越新)。
双击该文件夹,并在其中下载电脑操作系统对应平台的安装器即可
其他文件下载如大型插件/数据库链接
GO 富集分析 - go-basic.obo
请自行注意文件更新日期
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
## 官方最新
http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo
GO 注释相关
注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,无需下载数据,详细见教程https://www.yuque.com/go/doc/61378880
## idmapping.tb.gz ~10Gb
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
KEGG 富集分析 - XXX.TBtoolsKeggBackEnd
使用 TBtools 进行 KEGG 富集分析,往往建议用户使用 TBtools 自行生成 BackEnd 文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
内容包括:
Plants.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
Animals.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
Archaea.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
Bacteria.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
Eukaryotes.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
Fungi.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
Prokaryotes.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
Protists.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
KEGG 注释相关
注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,详细见教程https://www.yuque.com/go/doc/61378880
KEGG Pathway Mapp Illustrator - 通路着色数据库
KEGG 通路图稿上色并提供交互,一般建议用户使用 TBtools 自行准备好数据库文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载
## TBtoolsKEGGMap.DB
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
使用方式请参考
R插件相关
Rserver.plugin
所有 TBtools R 插件运行前均需要安装此插件
https://tbtools.cowtransfer.com/s/68df33e849a84c
DESeq2 Win64 Meta Package
为 Windows 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/436dba652f434b
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
DESeq2 MacOS Meta Package
为 MacOS 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/64c985fce6e84f
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
CHeatmapShiny Win64 Meta Package
为 Windows 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/2f8d3738f06c4e
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
CHeatmapShiny MacOS Meta Package
为 MacOS 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/271a7df578d646
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可
WGCNAshiny Win64 Meta Package
为 Windows 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/ed68de62d8c748
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
WGCNAshiny MacOS Meta Package
为 MacOS 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行
https://tbtools.cowtransfer.com/s/06bef979c3c44a
使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137
注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可
事实上,上述内容,从《TBtools Cookbook》照搬。
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《TBtools Cookbook》 - 写给「TBtools」所有用户的参考手册 https://www.yuque.com/cjchen/hirv8i
你想知道的,都在里面了:
1. 软件/数据库的下载/更新
2. 对应功能的使用说明与具体示例
3. 常见问题 FAQ 及解决方案
4. 如何有效提出 TBtools 使用问题从而快速获得回复并得到解决