iMeta公众号文章目录（2024.8.6）

最新推荐文章于 2025-03-23 21:00:41 发布
最新推荐文章于 2025-03-23 21:00:41 发布
阅读量209 收藏
点赞数
原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMjA4Njc1MA==&mid=2247512054&idx=3&sn=14d34c10a867d7e8a7067ff4ae9600dc&chksm=fb797ce32a994d38d3fce0b0b3aa3a12b1af0d270ce5b021844cb892804d18c2b74e7a942122&scene=126&sessionid=0
版权

       列表目录

    • iMeta—微生物组与生物信息顶刊

    • iMeta高被引论文

    • 生物信息/微生物组期刊

    • iMeta相关资讯

    • iMetaOmics相关资讯

    • iMeta最新文章中文版+视频

    • iMetaOmics最新文章中文版+视频

    • 第3卷第3期(2024.6)

    • 第3卷第2期(2024.4)

    • 第3卷第1期(2024.2)

    • 第2卷第4期(2023.12)

    • 第2卷第3期(2023.8)

    • 第2卷第2期(2023.5)

    • 第2卷第1期(2023.2)

    • 第1卷第4期(2022.12)

    • 第1卷第3期(2022.9)

    • 第1卷第2期(2022.6)

    • 第1卷第1期(2022.3)

    • iMeta典型文章系列讲座

    • 跟着iMeta学做分析和作图

    • ImageGP使用教程

iMeta—微生物组与生物信息顶刊

iMeta高被引论文
生物信息/微生物组期刊
iMeta相关资讯
iMetaOmics相关资讯
iMeta最新文章中文版+视频
iMetaOmics最新文章中文版+视频
第3卷第3期(2024.6)
第3卷第2期(2024.4)
第3卷第1期(2024.2)
第2卷第4期(2023.12)
第2卷第3期(2023.8)
第2卷第2期(2023.5)
第2卷第1期(2023.2)
第1卷第4期(2022.12)
第1卷第3期(2022.9)
第1卷第2期(2022.6)
第1卷第1期(2022.3)
iMeta典型文章系列讲座
跟着iMeta学做分析和作图
ImageGP使用教程

更多推荐

（▼ 点击跳转）

高引文章 ▸▸▸▸

iMeta | 引用13000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据

f78e807fb010a7f06aaada32af6e71f1.png

高引文章 ▸▸▸▸

iMeta | 德国国家肿瘤中心顾祖光发表复杂热图(ComplexHeatmap)可视化方法

e0b27101a6af59e3826f0872632f6a8f.png

高引文章▸▸▸▸

iMeta | 高颜值绘图网站imageGP+视频教程合集                                        

69d73e429af27087ee8b6441d73d0694.png

efa72b0cd5c7ca465b30bfad59e6f389.jpeg

1卷1期

d449481b0c24f263631248bad546790b.jpeg

1卷2期

0dc29ba0c0f53718e94b18fcb4f9729c.jpeg

1卷3期

2a09d6c6b77c25c081e6046e8e9d2a76.jpeg

1卷4期

6a198f456afce0647450f166f3d36ad0.jpeg

2卷1期

af957dc23c3ced752a406d98f1b759d1.jpeg

2卷2期

41213a6ea39e706cfe7bb70729a5610a.png

2卷3期

cb277a000bdd8ab0023ad214078b66f3.jpeg

2卷4期

9c8dc0129df63d061abb98e781d97e79.png

3卷1期

b17dc61e21a45abb63cf795937d04555.png

2卷2期封底

ae509e9ec2b316252970a82dc14121e3.jpeg

2卷4期封底

b14f5ea66111e62d4a363fb706a1be0b.jpeg

3卷2期

5d2e6b9eec7af6f59c34dc326c54e8a7.png

3卷3期

a525dfc943dff0851107baadaf745f76.jpeg

3卷3期封底

期刊简介

“iMeta” 是由威立、肠菌分会和本领域数百千华人科学家合作出版的开放获取期刊，主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述，重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括视频投稿、可重复分析、图片打磨、青年编委、前3年免出版费、50万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊发行！发行后相继被Google Scholar、ESCI、PubMed、DOAJ、Scopus等数据库收录！2024年6月获得首个影响因子23.7，位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848)，微生物学科2/161，仅低于Nature Reviews，同学科研究类期刊全球第一，中国大陆11/514！

“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，是定位IF>10的高水平综合期刊，欢迎投稿！

iMeta主页：

http://www.imeta.science

姊妹刊iMetaOmics主页：

http://www.imeta.science/imetaomics/

出版社iMeta主页：

https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770596x

出版社iMetaOmics主页：

https://onlinelibrary.wiley.com/journal/29969514

iMeta投稿：

https://wiley.atyponrex.com/journal/IMT2

iMetaOmics投稿：

https://wiley.atyponrex.com/journal/IMO2

邮箱：

office@imeta.science

刘永鑫Adam
关注
QIIME 2教程. 22Python命令行模式Artifact API(2024.2)
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
04-27 832
Python命令行模式Artifact APIArtifact API (using QIIME 2 with Python)https://docs.qiime2.org/2024.2/interfaces/artifact-api/https://www.bilibili.com/video/BV1x1421R773/注：本指南假定您已执行“04人体微生物组分析Moving Pictures”...
Cell Host & Microbe | 郭春君团队系统探究肠道微生物的氨基酸代谢及其对宿主氨基酸水平和血糖耐受的影响...
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
05-23 2623
肠道氨基酸的微生物代谢影响宿主营养平衡和生理Microbiota metabolism of intestinal amino acids impacts host nutrient homeostasis and physiologyArticle, 2023-04-23, Cell Host & Microbe, [IF 30.3]原文链接：https://doi.org/10.101...
喜讯 | iMeta正式被ESCI收录！期待明年首个影响因子，预计IF>15
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
12-26 2794
2023年12月19日，iMeta正式被科睿唯安（Clarivate）旗下Emerging Sources Citation Index（以下简称ESCI）数据库收录。https://mjl.clarivate.com这是继DOAJ、Scopus、Google Scholar、ResearchGate、 Dimensions数据库收录之后iMeta入选的又一重要数据库，标志着iMeta在国际上的影...
iMeta姊妹刊iMetaomics(定位IF>10)欢迎投稿！
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
02-28 3825
点击蓝字 关注我们iMeta姊妹刊iMetaomics(定位IF>10)欢迎投稿！iMetaomics 简介IntroductioniMeta定位IF>20，范围对标Nature Biotechnology/Methods/Microbiology、Cell Host & Microbe、Lancet Microbe等大子刊；iMeta姊妹刊iMetaomics定位IF>...
中科院分区表2025 | iMeta入选生物学一区Top期刊
悟道西方
03-23 314
目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。2024年6月获得首个影响因子23.8，位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848)，微生物学科2/161，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆11/514！
iMeta宏基因组&生物信息期刊-创刊背景和简介
悟道西方
11-23 1279
全球出版物数量分布：中国办刊数量远低于国际平均水平，总量为美国的6.2%和英国的13.7%，人均仅为英美的1.4%和0.65%，与世界第一人口大国和第二经济体极端不匹配中国-高水平文章vs...
iMeta获得首个影响因子，位列微生物学研究期刊全球第一，SCI期刊Top 1%(2024/6/20)...
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
06-21 1369
iMeta获得首个影响因子据Clarivate发布的2023年期刊引证报告（JCR）于2024年6月20日发布，iMeta 喜获首个影响因子：23.7！位列微生物学期刊全球2/161，仅低于Nature Reviews，同学科研究类期刊全球第一。iMeta在JCR数据库中影响因子截图https://jcr.clarivate.com/微生物学科期刊IF排名，iMeta位列2/161，图中仅显示IF...
2024年实时影响因子: 全球微生物和生物技术期刊(25.2.5更新)
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
02-06 995
点击蓝字 关注我们2024年实时影响因子: 全球微生物和生物技术期刊经过Web of Science 官网对引用前50和IF排名前50的全球微生物（Microbiology）及生物技术和应用微生物学（Applied microbiology and biotechnology）期刊进行了2024年影响因子计算。结果显示，76本期刊仅有5本突破20分，分别为Nature Reviews Drug D...
MPB | 中科院城环所杨军组-​​​基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法...
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
07-03 997
基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法Library construction for DNA metabarcoding of bacterioplankton communities in waters肖鹏1，续子杰1, 2，杨军1, *1水生态健康研究组，城市环境与健康重点实验室，福建省流域生态重点实验室，中国科学院城市环境研究所，厦门，福建；2中国科学院大学，北京*通讯作者邮箱:...
MPB | 中科院植物所杨文强组-​莱茵衣藻遗传连锁分析方法
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
06-23 1099
莱茵衣藻遗传连锁分析方法Protocol of Genetic Linkage Analysis in Chlamydomonas reinhardtii韩菲1，杨文强1, 2, 3，邢家乐1, *1中国科学院植物研究所光生物学重点实验室，北京 100093；2中国科学院大学，北京 100049；3中国科学院种子创新研究院，北京 100093*通讯作者邮箱: xingjiale@ibcas.ac....
QIIME 2教程. 20进化树推断q2-phylogeny(2024.2）
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
04-26 1252
使用q2-phylogeny进行系统发育推断Phylogenetic inference with q2-phylogenyhttps://docs.qiime2.org/2024.2/tutorials/phylogeny/https://www.bilibili.com/video/BV1Vm421s7dr/开始本节分析前，我们假定你已经完成了前面内容的学习。在QIIME 2中可用的几个下游多...
iMeta姊妹刊iMetaomics编委招募 (定位IF>10)
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
03-04 282
点击蓝字 关注我们iMeta姊妹刊iMetaomics编委招募(定位IF>10)iMetaomics 简介IntroductioniMeta定位IF>20，范围对标Nature Biotechnology/Methods/Microbiology、Cell Host & Microbe、Lancet Microbe等大子刊；iMeta姊妹刊iMetaomics定位IF>...
iMeta | 2024年完美收官: 发文103篇, 总被引5843次, 因为有你2025将更精彩
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
01-01 452
01iMeta｜2024年总结报告截至2024年12月31日，iMeta共发行3卷14期，其中2022年和2023年各4期，2024年6期；共发表论文244篇，其中2024年发文103篇；文章总引用5843次，平均引用24.65，2024年引用3792。iMeta主页：http://www.imeta.science出版社iMeta主页：https://onlinelibrary.wiley.co...
iMetaOmics | 浙江大学宗鑫组-比较多组学分析揭示品种对猪结肠宿主-微生物相互作用的影响...
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
07-10 689
点击蓝字 关注我们比较多组学分析揭示品种对猪结肠宿主-微生物相互作用的影响研究论文●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.8●2024年7月4日，浙江大学宗鑫团队在iMetaOmics在线发表了题为“Comparative multiomics analyses reveal the breed effect on the colonic host–micr...
iMetaOmics | 通过整合宏组学促进人类与环境健康发展
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
09-01 777
点击蓝字 关注我们通过整合的宏组学促进人类与环境卫生进步综 述●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.21●2024年8月8日，中国农科院基因组所食品中心刘永鑫、香港中文大学医学院于君、中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在iMetaOmics在线发表了题为“Advancing human and environmental health through...
2024年影响因子预测: 微生物学期刊
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
10-05 871
点击蓝字 关注我们2024年影响因子预测: 微生物学期刊经过Web of Science 官网对微生物学领域引用前30和影响因子排名前30的期刊进行了2024年影响因子预测。结果显示，46本微生物学期刊2024年影响因子平均增长了8.5%，33本增长，13本下降，其中Nature Reviews Microbiology的影响因子最高，估计可达104.6，其次是iMeta，估计可达33.7。影响因...
iMeta期刊34位编委入选2023年全球高被引学者
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
12-24 1742
iMeta期刊 34 位编委入选2023年全球高被引学者科睿唯安2023年度“高被引科学家”名单出炉，高被引学者查询：https://clarivate.com/highly-cited-researchers经iMeta期刊编辑部不完全统计，截止发稿时已经查询到34位编委入选全球高被引学者，他们在本领域的研究中引用数量是真正的千里挑一(Top 0.1%)，彰显了他们在同行中的重要学术影响力。入选...
iMeta大会2024 (10.11-13深圳) 第一轮通知
悟道西方
08-20 130
iMeta大会2024：构建创新型科研生态iMetaiMeta期刊是生物技术、微生物组和生物信息交叉学科期刊，主编刘双江和傅静远教授，影响因子23.7，位于全球微生物学科研究类第一，全球排名前千分之五(107/21848)，中国大陆排名11/514，广东省第一。子刊iMetaOmics主编赵方庆和于君教授，定位IF > 10的高水平交叉学科综合期刊，欢迎投稿！iMeta大会是由iMeta编...
iMeta | 首都医科大学陈汉清-肠道菌群靶向纳米药物治疗结直肠癌的挑战与机遇...
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
06-19 595
点击蓝字 关注我们肠道菌群靶向纳米药物治疗结直肠癌的挑战与机遇iMeta主页：http://www.imeta.science综 述●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.213●2024年6月10日，首都医科大学陈汉清团队在iMeta在线发表了题为 “The challenge and opportunity of gut microbiota-tar...
读取"C:\Users\wanglihui2\Desktop\imeta.xlsx"文件的doi列，存储为txt文件
最新发布
04-04
<think>好的，用户现在想要把Excel文件中的doi列读取出来，存储为txt文件。之前用户的问题是关于如何修改代码从txt转为Excel，现在需求又变成了反过来，把Excel中的doi列导出到txt。 首先，我需要确定用户的需求是什么。用户可能是在处理文献管理，需要批量下载文献，而doi号存放在Excel中，但某些情况下可能需要用txt文件来处理，比如其他脚本需要读取txt中的每一行作为输入。 接下来，我需要考虑用户可能的背景。用户之前使用了Python和多线程下载，说明有一定的编程基础，但可能对文件处理特别是Excel操作不太熟悉。用户可能需要一个简单直接的方法来实现这个转换，不需要复杂的配置。 然后，我要回顾之前的对话历史。之前我教过用户如何用pandas读取Excel中的doi列，现在用户可能希望将结果保存为txt，所以需要结合之前的代码，添加写入txt的部分。 现在，步骤应该是：安装必要的库（如果还没安装的话），读取Excel文件，提取doi列，处理空值，然后将这些doi写入txt文件，每行一个。同时，需要处理可能的异常，比如列不存在或者文件路径错误。 需要注意的几点：文件路径在Windows中的转义问题，使用原始字符串或者双反斜杠；确保Excel中有doi列，否则要报错；处理可能存在的空值，避免写入空行；写入txt时换行符的处理。 另外，用户可能希望生成的txt文件的路径和名称，可能需要询问用户，但用户没有指定，所以默认保存在同一目录下比较合理，比如imeta_doi.txt。 潜在的问题可能有：Excel文件被其他程序打开导致无法读取，doi列中有非字符串类型的数据，或者编码问题导致写入txt时出错。需要确保使用正确的编码，比如utf-8。 最后，需要给出一个完整的代码示例，并解释每个步骤，确保用户能够理解并调整参数。同时提醒可能需要注意的地方，比如路径问题、列名是否正确等。</think>我将分步骤说明如何从Excel读取DOI列并保存为TXT文件，并提供可直接运行的代码： --- ### **完整解决方案** ```python import pandas as pd # 定义文件路径（注意转义符处理） excel_path = r"C:\Users\wanglihui2\Desktop\imeta.xlsx" txt_path = r"C:\Users\wanglihui2\Desktop\doi_list.txt" # 输出文件路径 try: # 读取Excel文件 df = pd.read_excel(excel_path, engine='openpyxl') # 提取doi列并过滤空值 doi_series = df['doi'].dropna() # 转换为纯字符串列表（处理可能的数字DOI） doi_list = [str(doi).strip() for doi in doi_series] # 写入txt文件 with open(txt_path, 'w', encoding='utf-8') as f: f.write('\n'.join(doi_list)) print(f"成功导出 {len(doi_list)} 个DOI到 {txt_path}") except KeyError: print("错误：Excel文件中未找到'doi'列") except FileNotFoundError: print(f"错误：文件 {excel_path} 不存在") ``` --- ### **关键步骤说明** 1. **路径处理** - 使用原始字符串 `r"..."` 避免`\`转义问题 - 输出文件默认与原Excel同目录，可修改`txt_path`自定义位置 2. **数据清洗** - `dropna()` 过滤空单元格 - `str(doi).strip()` 强制转为字符串并去除首尾空格 3. **异常处理** - `KeyError`：检测列名是否存在 - `FileNotFoundError`：检测文件路径有效性 4. **输出格式** 每个DOI独立成行，符合多数文献下载工具的要求 --- ### **使用前准备** 1. 安装依赖库（若未安装）： ```bash pip install pandas openpyxl ``` --- ### **效果验证** 生成的TXT文件示例： ``` 10.1038/s41586-023-06111-7 10.1016/j.cell.2023.04.012 10.1126/science.adh5017 ``` --- ### **常见问题处理** 1. **列名不符**：若实际列名为`DOI`/`文献号`，修改`df['doi']`为对应列名 2. **特殊格式**：若DOI被Excel识别为数字，`str()`转换可保留科学计数法的完整数字 3. **编码问题**：如遇乱码，可将`encoding='utf-8'`改为`encoding='gbk'` 需要调整具体输出格式或处理逻辑可随时告知。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值