R语言绘图——组间差异箱线图图，小提琴图、聚类热力图、相关系数热力图

注：本文摘自于公众号：科研生信充电宝，R语言50绘图|50期R语言绘图汇总大合集

箱线图：使用ggboxplot()函数来展示数据在多组间的差异

在做图时：

一般需要根据及以表达结果提取三列信息：

① Type: 样本类型

用作——展示在我们的X轴

用作——展示在我们的颜色填充分组

② Expression：数据大小

  用作——展示在我们的Y轴

例子：根据基因在多组间的差异表达结果，使用箱线图进行展示。

① 设置目录：

#设置工作目录
setwd("") # 注意双\\加入地址

② 导入数据：

#引用包
library(reshape2)
library(ggpubr)
inputFile="input.txt"       #输入
outFile="barplot.pdf"       #输出

#读取输入文件
rt=read.table(inputFile,sep="\t",header=T,check.names=F)
x=colnames(rt)[2]
y=colnames(rt)[3]
colnames(rt)=c("id","Type","Expression")