分析背景
在前段时间,小编给各位小伙伴们介绍了使用ggplot2包绘制差异基因火山图,私底下有小姐姐向小编反应说图形不够美观,毕竟这个这是个看脸的时代,今天小编给小伙伴们介绍使用ggpubr包绘制带有自定义有颜色的标签,如下图所示,是不是耳目一新。
ggpubr是由Alboukadel Kassambara基于ggplot2、ggsci包开发的,用于绘制符合出版物要求的图形。该包封装了很多ggplot2的绘图函数,并且内嵌了ggsci中很多优秀的学术期刊配色方案,值得学习使用。
ggpubr包括一些关键的特性:
- 能帮助研究人员快速创建易于发表的图形
- 能够将P值和显著性水平自动添加到图形上而无需二次编辑
- 使图形注释和排版变得容易
- 使更改图形参数(例如颜色和标签)变得容易
小编,在后期使用这个包给大家绘制各种常见的图形,如小提琴图、箱线图、散点图等等。记得关注公众号,干货满满!!!
分析方法
# 安装R包
if (!requireNamespace("ggplot2", quietly = TRUE))
install.packages("ggplot2",repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")
if (!requireNa