综述:《医疗知识图谱:资源、应用和前景》

本文系统地探讨了医疗知识图谱在医疗保健领域的应用、构建方法以及未来发展潜力。文章首先介绍了知识图谱的概念及其在不同领域的应用,然后重点阐述了医疗知识图谱的定义、构建方法和利用方式,并对现有的医疗知识图谱资源进行了总结和分类,最后展望了医疗知识图谱在大语言模型(LLMs)时代的发展机遇。

文章指出,医疗知识图谱作为一种重要的数据结构,能够获取生物医学概念及其之间的关系,从而促进医疗保健领域的研究和应用。与一般的知识图谱相比,医疗知识图谱更加关注医疗保健领域的特定概念,例如药物、疾病、基因、表型等,以及它们之间的复杂关系。文章强调了医疗知识图谱在整合来自不同来源的异构数据方面的优势,例如电子病历、医学文献、临床指南和患者生成的数据等。这些数据通常是异构且分散的,难以有效整合和分析,而医疗知识图谱能够提供一种统一的框架,将这些数据整合起来,形成一个更全面、更准确的知识表示。

文章详细介绍了医疗知识图谱的构建方法,主要分为两种:从零开始构建和整合现有资源。从零开始构建医疗知识图谱需要经历多个步骤,包括定义模式、收集数据、提取知识三元组、实体和关系规范化、推断缺失链接以及更新和验证等。每个步骤都需要运用特定的技术和算法,例如自然语言处理(NLP)技术用于实体和关系提取,图数据库用于知识推理和缺失链接推断。文章特别强调了近年来大语言模型在医疗知识图谱构建中的作用。大语言模型能够有效地处理异构数据,提高实体和关系提取的准确性和效率,从而构建更全面、更准确的医疗知识图谱。

文章还介绍了医疗知识图谱的两种应用方式:模型无关的应用和模型驱动的应用。模型无关的应用主要指利用查询语言直接查询医疗知识图谱,获取所需信息。这种方法简单直接,适用于一些简单的查询任务。模型驱动的应用则更加复杂,它通常需要利用机器学习模型,例如医疗知识图谱嵌入模型和符号逻辑模型,对医疗知识图谱进行更深入的分析和推理。医疗知识图谱嵌入模型能够学习实体和关系的低维向量表示,从而能够应用于各种深度神经网络中,解决更复杂的医疗保健问题。符号逻辑模型则能够进行可解释的逻辑推理,为医疗决策提供更可靠的依据。

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文章对现有的医疗知识图谱资源进行了总结,列举了多个具有代表性的医疗知识图谱,并对它们的节点类型、边类型、统计数据和应用进行了详细介绍。这些资源涵盖了医疗保健领域的多个方面,例如药物化学、生物信息学、临床决策支持和公共卫生等。文章还对医疗知识图谱在不同医疗保健应用中的作用进行了深入探讨,包括基础科学研究、药物开发、临床决策支持和公共卫生等。在基础科学研究方面,医疗知识图谱可以帮助研究人员识别新的表型和基因型关联,理解疾病的潜在机制,从而开发更有效的治疗方法。在药物研发方面,医疗知识图谱可以用于预测药物相互作用、药物靶标相互作用等,从而加快药物研发进程。在临床决策支持方面,医疗知识图谱可以为临床医生提供相关的医学信息,提高临床工作效率和改善患者预后。在公共卫生方面,医疗知识图谱可以用于疾病监测、疫情预测和公共卫生政策制定等。

文章最后展望了医疗知识图谱在大语言模型时代的发展机遇。随着大语言模型技术的不断发展,医疗知识图谱的构建和利用将会更加高效和便捷。大语言模型可以用于自动构建医疗知识图谱,提高医疗知识图谱的准确性和完整性。同时,大语言模型也可以与医疗知识图谱结合,构建更强大的医疗保健应用系统,例如智能问答系统、临床决策支持系统和疾病预测系统等。文章也指出了医疗知识图谱发展中面临的挑战,例如数据质量、数据隐私、知识图谱的可解释性和可信度等,这些都需要进一步的研究和解决。

总而言之,这篇综述文章全面地总结了医疗知识图谱的研究现状,并对未来的发展方向进行了展望。文章内容翔实,逻辑清晰,对医疗保健领域的研究人员和从业者具有重要的参考价值。文章强调了医疗知识图谱在整合异构数据、促进知识发现和推动医疗保健应用发展方面的巨大潜力,为医疗知识图谱的未来发展指明了方向,也为推动医疗保健领域的智能化转型提供了重要的理论基础和技术支撑。文章还特别指出,虽然大语言模型极大地促进了医疗知识图谱的构建,但如何保证开放世界假设下医疗知识图谱的质量,特别是可解释性和可信度,仍然是有待解决的研究性问题。

如何学习大模型 AI ?

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第一阶段(10天):初阶应用

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  • 大模型 AI 能干什么?
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  • 用好 AI 的核心心法
  • 大模型应用业务架构
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  • 代码示例:向 GPT-3.5 灌入新知识
  • 提示工程的意义和核心思想
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第二阶段(30天):高阶应用

该阶段我们正式进入大模型 AI 进阶实战学习,学会构造私有知识库,扩展 AI 的能力。快速开发一个完整的基于 agent 对话机器人。掌握功能最强的大模型开发框架,抓住最新的技术进展,适合 Python 和 JavaScript 程序员。

  • 为什么要做 RAG
  • 搭建一个简单的 ChatPDF
  • 检索的基础概念
  • 什么是向量表示(Embeddings)
  • 向量数据库与向量检索
  • 基于向量检索的 RAG
  • 搭建 RAG 系统的扩展知识
  • 混合检索与 RAG-Fusion 简介
  • 向量模型本地部署

第三阶段(30天):模型训练

恭喜你,如果学到这里,你基本可以找到一份大模型 AI相关的工作,自己也能训练 GPT 了!通过微调,训练自己的垂直大模型,能独立训练开源多模态大模型,掌握更多技术方案。

到此为止,大概2个月的时间。你已经成为了一名“AI小子”。那么你还想往下探索吗?

  • 为什么要做 RAG
  • 什么是模型
  • 什么是模型训练
  • 求解器 & 损失函数简介
  • 小实验2:手写一个简单的神经网络并训练它
  • 什么是训练/预训练/微调/轻量化微调
  • Transformer结构简介
  • 轻量化微调
  • 实验数据集的构建

第四阶段(20天):商业闭环

对全球大模型从性能、吞吐量、成本等方面有一定的认知,可以在云端和本地等多种环境下部署大模型,找到适合自己的项目/创业方向,做一名被 AI 武装的产品经理。

  • 硬件选型
  • 带你了解全球大模型
  • 使用国产大模型服务
  • 搭建 OpenAI 代理
  • 热身:基于阿里云 PAI 部署 Stable Diffusion
  • 在本地计算机运行大模型
  • 大模型的私有化部署
  • 基于 vLLM 部署大模型
  • 案例:如何优雅地在阿里云私有部署开源大模型
  • 部署一套开源 LLM 项目
  • 内容安全
  • 互联网信息服务算法备案

学习是一个过程,只要学习就会有挑战。天道酬勤,你越努力,就会成为越优秀的自己。

如果你能在15天内完成所有的任务,那你堪称天才。然而,如果你能完成 60-70% 的内容,你就已经开始具备成为一名大模型 AI 的正确特征了。

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### 显示每次提交前差异的方法 在 Git 中,可以通过 `git diff` 其他辅助命令来查看每次提交之前的差异。以下是实现这一目标的具体方法: #### 使用 `git diff HEAD~1` 要查看最近一次提交 (`HEAD`) 与其父提交 (`HEAD~1`) 的差异,可以运行以下命令: ```bash git diff HEAD~1 HEAD ``` 这条命令会显示当前分支最新的一次提交所引入的变化[^1]。 #### 自动化流水线中的应用 对于自动化流水线的需求,通常需要结合脚本动态获取最新的两次提交并计算其差异。例如,在 CI/CD 流水线中,可以使用如下方式获取上一次提交的哈希值并与当前提交进行对比: ```bash PREV_COMMIT=$(git rev-parse HEAD~1) CURRENT_COMMIT=$(git rev-parse HEAD) git diff $PREV_COMMIT $CURRENT_COMMIT ``` 上述代码片段能够帮助开发者或工具自动检测每次提交带来的具体更改[^5]。 #### 处理 Merge 提交的情况 当遇到 merge 类型的提交时,默认情况下可能会导致不期望的结果。为了确保只关注实际修改的内容而非合并操作本身的影响,推荐采用三路比较模式 (three-dot syntax),即: ```bash git diff HEAD~1...HEAD ``` 此语法专注于展示由本次提交单独引起的改动部分而忽略那些仅因合并产生的重复内容[^4]。 #### 特定文件或者目录下的差异 如果只想了解某一部分(比如某个子目录或单个文件)内的变动情况,则可以在原有基础上附加路径参数。例如: ```bash git diff HEAD~1 -- path/to/directory/or/file ``` 这样就可以限定范围至指定区域内的变化记录了[^2]。 ### 总结 综上所述,利用 `git diff` 结合适当选项上下文信息(如 commit id 或者相对位置), 可以有效地追踪每一次提交之前所做的调整, 并满足各种场景需求包括但不限于日常开发以及持续集成环境当中.
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