转录组小知识点收集

本文介绍了转录组的概念,包括其广义和狭义定义,并重点讲解了RNA-Seq技术在转录组学研究中的应用。通过RNA-Seq,可以对生物样品的基因表达状况进行全面了解,并在转录层面分析基因表达变化。同时,提到了链特异性文库构建的重要性以及常用的测序平台Hiseq 2500。
摘要由CSDN通过智能技术生成

转录组即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA。

RNA-Seq,是基于新一代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集,然后反转录为 cDNA后进行的新一代高通量测序,在此基础上进行片段的拼接组装,从而可得到一个个的转录本,进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较分析,则可以在转录层面得到基因表达水平的变化,针对关键基因则可以进行代谢通路(Pathway)的构建。

转录组(Transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA (mRNA)、核糖体

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