huamnn3使用笔记

huamnn --version # 确认安装,查看版本号(我的是v3.8)

humann_config # 查看服务器中的数据库路径

看到前两个database_folders的最后都是DEMO,如果这样去跑的话就会出现错误

ERROR: You are using the demo ChocoPhlAn database with a non-demo input file. If you have not already done so, please run humann_databases to download the full ChocoPhlAn database. If you have downloaded the full database, use the option --nucleotide-database to provide the location. You can also run humann_config to update the default database location. 

wget full = http://huttenhower.sph.harvard.edu/humann_data/chocophlan/full_chocophlan.v201901_v31.tar.gz

(下面的红字填写自己下载上述文件的路径)

humann_config --update database_folders nucleotide /home/user/database
 

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当然,我可以为您提供关于Wireshark的使用笔记。下面是一些基本的使用说明: 1. 下载和安装:您可以从Wireshark官方网站(https://www.wireshark.org)下载适用于您操作系统的最新版本,并按照安装向导进行安装。 2. 打开Wireshark:安装完成后,打开Wireshark应用程序。在Windows上,您可以在开始菜单中找到它;在Mac上,您可以在启动台中找到它。 3. 选择网络接口:在Wireshark界面的主窗口中,选择要捕获数据包的网络接口。您可以从列表中选择一个接口,并点击“开始”按钮开始捕获数据包。 4. 捕获数据包:Wireshark将开始捕获选定网络接口上的数据包。您将看到一个实时的数据包列表,显示每个数据包的详细信息。 5. 分析数据包:您可以通过单击数据包来查看其详细信息,包括源地址、目标地址、协议等。Wireshark还提供了各种过滤和排序选项,以帮助您更好地分析数据包。 6. 应用过滤器:Wireshark支持使用过滤器来仅显示您感兴趣的数据包。您可以在“过滤器”框中输入过滤条件,并点击“应用”按钮来应用过滤器。 7. 保存和导出数据包:如果您想保存捕获的数据包以供后续分析,可以使用Wireshark的“保存”选项。您还可以导出捕获的数据包为其他格式,如PCAP、CSV等。 这是一些Wireshark的基本使用笔记,希望对您有所帮助。如果您有任何进一步的问题,请随时提问!

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