R中安装packages 网络超时,下载不完全

当安装大型R包如org.Hs.eg.db时,由于网络速度限制可能导致下载不完整。文章介绍了如何通过切换到国内镜像源,如清华大学源,来解决这个问题。通过修改`options`中的`BioC_mirror`和`CRAN`设置,可以有效提高下载速度并顺利完成安装。
摘要由CSDN通过智能技术生成

问题:安装比较大的R包时,会遇见:网络太慢(只有300秒)导致包没完全下载完,然后报错,如图所示,安装80M的org.Hs.eg.db,网速慢,没下载完就报错:

解决方法:

截图中可以看到,当前下载源为cran.rstudio,网速比较慢

切换到国内源,比如清华源,网速比较快

options("repos") #查看当前下载源
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN"))

切换后,下载成功。

 

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