bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道,现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像,下载安装生物信息软件速度十分缓慢,经常中断,生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。
2019.6.15高兴地看到大家相互转告清华源恢复了。
1. Anaconda 仓库的镜像,运行以下命令:
#Anaconda Python 免费仓库
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
#Conda Forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
#msys2
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
#bioconda
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
#menpo
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
#pytorch
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
# for legacy win-64
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/peterjc123/
conda config --set show_channel_urls yes
北外的备用
#Anaconda Python 免费仓库
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
#Conda Forge
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
#msys2
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
#bioconda
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
#menpo
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
#pytorch
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
# for legacy win-64
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/peterjc123/
conda config --set show_channel_urls yes