如何熟练掌握分子动力学LAMMPS软件模拟

随着理论化学及计算机技术的发展，分子模拟技术被越来越多地用来加快科学研究与开发过程。分子动力学模拟方法以统计热力学、分子力学及牛顿力学为基础，对纳观体系的状态与过程进行精细研究，已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程、物理等研究领域。理解分子动力学模拟理论基础并掌握相应软件的操作与特点对于相关领域的研究工作尤为重要。

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一、LAMMPS分子动力学模拟用处，条件及经验分享

1 为什么要学习LAMMPS分子动力学模拟？

1.1 分子模拟概述

1.2 分子动力学模拟的重要性

1.3 分子动力学模拟的基本原理

1.4 分子动力学模拟的应用范围简介

1.5 做好模拟所需的硬件条件与研究基础

二、LAMMPS操作基础及模拟流程详解

2. LAMMPS操作基础及模拟流程详解

2.1 Linux/Windows下LAMMPS的安装及配置

2.2 Linux/Windows下常用命令介绍

2.3 系综理论/温度和压力的控制/周期性边界

2.4 常见的分子力场及势函数的选择

2.5 完整模拟流程概述

三、操作文件详解---输入/计算/结果分析

3. 操作文件详解---输入/计算/结果分析

3.1 in文件语法结构及常用命令

3.2 计算过程监控及调控

3.3 力场势函数详解和参数说明

3.4 结果输出及循环过程模拟

3.5 输出数据分析

四、聚合物体系结构及力学性能模拟

4.1 建立无规聚合物链初始结构

4.2 初始结构合理性分析

4.3 聚合物结晶过程模拟

4.4 单轴拉伸过程模拟

4.5 数据后处理及分析

五、气体扩散及分离过程模拟

5.1 受限空间或孔道结构等初始结构构建

5.2 常见气体分子的力场模型

5.3 扩散或分离过程模拟的in文件

5.4 数据后处理及分析

5.5 常见问题及解决方案

六、基于反应力场的聚合物热裂解及LAMMPS分子动力学模拟常见错误解析

6.1 反应力场简介

6.2 聚合物热裂解模拟in文件及力场参数设置

6.3 输出结果解析

6.4 LAMMPS分子动力学模拟常见错误及解决途径

七、基于拟合力场的气体扩散过程模拟

7.1 力场拟合常见方法

7.2 基于DFT数据两体势参数拟合

7.3 力场可靠性验证

7.3 基于拟合力场的气体扩散过程模拟

7.4机器学习在力场拟合中的应用